中国姬鼠属分类与系统发育研究

Wood mouse (genus Apodemus) is the common rodent in the broad-leaved forests in Temperate Zone of Palearctic region, and has marginal distribution in the Oriental region. They are widely distributed in Europe and Asia and have plentiful species and subspecies. There are 21 taxa distributed in China, and the status of A. orestes, A. chevrieri, A. semotus and A. latronum are still indeterminate. The phylogenetic relationships among species is still unsolved, and the evolution process is poorly documented. In this project, we intend to evaluate the status of taxa distributed in China by the integrated taxonomy (morphology, ecology and heredity), restructure the phylogenetic tree based on the complete mitochondrial genome and ten nuclear gene fragments, estimate the divergence time of each node with the fossil record as correcting point, and represent the distribution area and migration route of ancestor to explore the origin and the drive of radiation.

姬鼠属是古北区温带阔叶林常见鼠种，在东洋区呈边缘化分布。其分布范围广，跨欧洲和亚洲两个大洲，物种和亚种分化较多。在我国分布有21个分类单元中，长尾姬鼠、高山姬鼠、台湾姬鼠和大耳姬鼠的分类地位仍存有争议，且分布于我国的姬鼠的系统发育关系尚未完全解决，其进化历史也有待探讨。本项目拟利用整合分类学方法（形态、生态和遗传）厘定分布于中国各分类单元的分类地位，利用线粒体基因组数据以及10个核基因序列构建其系统发育树，结合化石记录估算其分化时间，并再现其祖先分布及迁徙路线，探讨姬鼠的起源、辐射及进化的历史及其驱动力。

姬鼠属（Apodemus）是最古老的啮齿类动物之一，仅在东洋区呈边缘分布。我国是姬鼠的重要分布区之一，在大部分地区均有分布，但具体的物种数量因其分类系统不稳定而产生了不同的观点。有关姬鼠属系统发育关系的研究较多，但多偏向于关注某一个地区或一定范围内的物种，我国范围内系统发育关系研究较少。本项目主要关注于国内境内姬鼠属的系统分类系统和发育关系，以地模标本为主，利用线粒体基因组构建姬鼠属系统发育关系，并进行分子种界定。结果表明：全球共约有18种姬鼠，在我国分布有9个种，其他的为其亚种或异名。本研究构建了基于我国分布种类的系统发育树，分布于我国的姬鼠在系统发育关系上可以划分为4个大支系，各种群间的关系得到了很好的支持。初步分歧时间估算表明，姬鼠物种间的分化可能收到5-7百万年前气候变干燥的影响。