杨树不定根发育的eQTL分析

杨树生根性状在遗传改良研究中占有重要地位。杨树的繁殖基本上依靠无性繁殖，因此生根能力强弱是无性系选择的重要性状。本研究以美洲黑杨和小叶杨为材料利用"遗传基因组学"策略（genetical genomics），联合传统的QTL分析方法和芯片表达分析技术，从基因表达层面研究控制杨树无性系不定根发育的调控机制，建立基因和表型的确切关系。通过构建遗传图谱和QTL分析结合杨树全基因组序列信息，以及构建不定根不同发育阶段之间的抑制消减杂交cDNA文库的方法筛选候选基因，制备cDNA芯片，研究分离群体个体间不定根发育相关基因的表达差异，通过QTL 分析与cDNA 芯片检测表达水平差异相结合的线性模型和多因子分析方法，获得控制不定根发育的候选基因，区分在转录水平上影响不定根发育的反式或顺式作用因子，并初步揭示不定根发育相关基因之间相互作用关系。