T细胞表位的高精度理论预测模型研究

T细胞表位预测包括细胞毒性T细胞（Tc）表位和辅助性T细胞(Th)表位预测两方面,是计算机辅助疫苗设计的重要研究内容之一,它通过计算方法对多肽片段能否成为表位进行理论评估。多肽片断必须满足两个条件才能成为T细胞表位：即自然产生（非人工合成）并能同MHC（主要组织相容性复合体,分I型、II型）分子结合，同MHC-I结合的是Tc表位，同MHC-II结合的是Th表位。因此，本课题研究基于相关向量机的MHC分子(I型,II型)结合肽的预测建模和基于粗糙集方法的蛋白酶体酶切位点的预测建模。对建模过程中涉及的数据预处理、氨基酸编码、不定长多肽序列的变换、领域相关的核函数设计、不均衡样本的处理等问题展开研究，探索T细胞自然表位的高精度理论预测方法。该方法有望对疫苗和药物的设计与开发，尤其是对表位疫苗、治疗性疫苗和抗体药物的设计、研制提供有效指导，从而节约大量的研究经费并大大加快疫苗和药物的设计进程。