食管鳞癌中组蛋白修饰状态及其对基因表达的调控作用

基本信息
批准号:81000905
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:20.00
负责人:陈晨
学科分类:
依托单位:中南大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:尹邦良,尹倪,匡峰,罗成,王保祥,何彬
关键词:
乙酰化甲基化食管鳞状细胞癌组蛋白抑癌基因
结项摘要

食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC) 是胸心外科常见恶性肿瘤之一,其发病率高,预后差,5年生存率仅为20%左右。其确切的病因及发病机制尚不清楚。目前认为组蛋白甲基化/乙酰化修饰异常是导致肿瘤中多种癌基因/抑癌基因表达失调和肿瘤细胞异常活化的重要机制之一,但在ESCC中上述分子机制仍未完全阐明。我们研究发现在ESCC病人当中组蛋白H3、H4呈整体低乙酰化,H3K4、H3K9整体高甲基化状态,同时组蛋白乙酰化/去乙酰化酶和甲基化/去甲基化酶表达异常,且与肿瘤分期密切相关。这提示了组蛋白修饰在ESCC发生发展过程中扮演重要角色。本研究拟在前期实验的基础上,探讨ESCC中组蛋白修饰对癌基因/抑癌基因表达的调控作用,筛选与ESCC发病密切相关的基因位点,进一步阐明ESCC发病的分子机制,并可能为ESCC的早期诊治提供新的思路和方向。

项目摘要

食管鳞状细胞癌(ESCC)是胸心外科常见的恶性肿瘤之一,其发病率呈逐年增高趋势。目前认为组蛋白甲基化/乙酰化修饰异常是导致肿瘤中多种癌基因/抑癌基因表达失调和肿瘤细胞异常活化的重要机制之一,但在ESCC中上述分子机制仍未完全阐明。本课题观察并确证了ESCC中存在着组蛋白H3、H4呈整体低乙酰化,H3K4、H3K9整体高甲基化状态,同时伴随有组蛋白乙酰化/去乙酰化酶和甲基化/去甲基化酶表达异常,这一过程与ESCC病理分期密切相关。这提示了组蛋白修饰在ESCC发生发展过程中扮演重要角色。进一步的,我们采用ChIP-sequencing技术检测ESCC中组蛋白H3K4和H3K27甲基化水平,采用RNA-seqencing技术检测ESCC转录组表达水平,得到了ESCC中组蛋白甲基化修饰状态和基因转录水平较为全面的数据。生物信息学分析显示H3K4和H3K27甲基化修饰调控了ESCC中多条基因转导通路,对多种癌基因/抑癌基因的表达具有调控作用,如PPAR 信号转导通路、细胞周期信号通路及P53信号通路等。本研究筛选出ESCC中与组蛋白H3K4和H3K27甲基化修饰密切相关的基因转导通路与关键基因靶点,如H3K4甲基化与肿瘤原癌基因Wnt3a、RAB3B、CXCL5的过表达密切相关;H3K27甲基化则可导致ESCC中抑癌基因ITIH5、PTEN、PCDH8及TIMP3等表达失活,这些都为更进一步深入研究组蛋白修饰在ESCC中的致病机制打下坚实的基础。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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