TLR9是识别CpG DNA的受体,确定TLR9识别CpG DNA的结构域具有重要意义。本项目在前期发现TLR9胞外段LRR2、5、11具有抑制细菌生长、与CpG DNA具有一定结合力的基础上,首先检测人工合成LRRs多肽与CpG DNA的亲和力(Kd值),初步确定高Kd值的LRR为TLR9结合CpG DNA的结构域(BD);观察BD对单核细胞TNF-α释放和CpG DNA内化的影响,确定BD。然后采用生物信息学技术分析LRRs结构的特点,初步确定BD的重要氨基酸位点;细菌生长抑制实验再次确定BD中重要的氨基酸位点;检测人工合成突变多肽与CpG DNA的Kd值;观察突变多肽对TNF-α释放和CpG DNA内化数量的影响,明确重要的氨基酸位点。最后,在HEK细胞株中转染双报告基因系统,比较野生型TLR9和TLR9的BD突变体活化NFκB的强度,最终确定TLR9的BD和重要氨基酸位点。
通过生物信息学分析、生物传感器和LRR多肽活性研究等策略,明确LRR11是人TLR9结合CpG ODN的主要结构域,5个正电荷位点尤其是R337、K338是LRR11结合CpG ODN的关键位点,完成本项目研究内容并达到预期目标。.人工合成预期可结合CpG ODN的TLR9胞外段LRR2、5、8、11片段(命名为LRR2、5、8、11多肽),生物传感器检测LRR多肽与CpG ODN的亲和力,仅LRR11具有高亲和力(4.79 nM),LRR2、5亲和力低,而LRR8几无亲和力;圆二色谱实验也表明LRR11可显著改变CpG ODN的空间构象,其余LRR作用较弱或无作用。进一步激光共聚焦检测显示LRR11对小鼠腹腔巨噬细胞内化CpG ODN的抑制作用最强,具有显著的量效关系;且LRR11对CpG ODN诱导的IκB降解、NF-κB活化及炎症细胞因子释放均有很强的抑制作用,具有高特异性和显著量效关系。采用CpG ODN刺激含野生型TLR9和突变TLR9的HEK293T细胞,显示LRR11缺失后TLR9通路活化下降显著,确认LRR11是CpG ODN的主要结合域。.为明确LRR11中重要的氨基酸位点,对TLR9和LRR11进行生物信息学分析,显示LRR11的5个正电荷位点R337、K338、K347、R348和H353形成2个正电荷区域,可结合带负电的CpG ODN。进一步检测上述5个位点单突变或组合突变的多肽(LRR11突变肽)与CpG ODN的亲和力,显示其与CpG ODN的亲和力均下降,R337、K338突变肽下降最多。在细胞实验中,突变肽不同程度逆转LRR11对CpG ODN内化和TLR9通路活化的抑制作用,其中含R337、K338的突变肽影响最大。TLR9和CpG ODN的分子对接显示R337和K338通过氢键与CpG ODN结合,而K347、R348和H353不直接结合CpG ODN,但可维持受体与CpG ODN结合面的稳定。上述结果表明5个正电荷位点尤其是R337、K338是LRR11结合CpG ODN的关键位点。.超额完成计划任务,在著名SCI刊物The Journal of Biological Chemistry (JBC)发表论著1篇(IF4.773>3.0),国内CSCD期刊发表专家述评1篇,达到预期研究成果要求,并额外获国家发明专利授权1项。
{{i.achievement_title}}
数据更新时间:2023-05-31
DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences
神经退行性疾病发病机制的研究进展
MK-FSVM-SVDD: A Multiple Kernel-based Fuzzy SVM Model for Predicting DNA-binding Proteins via Support Vector Data Description
A label-free fluorescent probe for accurate mitochondrial G-quadruplex structures tracking via assembly hindered rotation induced emission
DNA methylation level of promoter region of activating transcription factor 5 in glioma
我国中高纬度地区冷水鱼肠道乳酸菌多样性、系统发育及优势种群Enterococcus的遗传多态性研究
CpG-ODN与受体TLR9在酸性内体中的结合及其信号转导的触发
CpG-ODN与受体TLR9在酸性内体中的结合及其信号转导的触发
CpG甲基化与Toll样受体9在食管癌肿瘤免疫逃逸中的作用
Toll样受体9在肾衰后血管钙化中的作用及机制