乳杆菌高通量分类鉴定研究

本课题以核酸数据库公布的乳杆菌基因全序列为依据，运用生物信息学手段对其进行比对分析，找出乳杆菌菌株间相对保守以及相对差异的特异性基因序列片断，并结合乳杆菌16S以及23S rDNA序列来设计特异性探针，以此为根据设计并制备基因芯片。以从内蒙古、新疆、青海、云南及蒙古国等少数民族地区自然发酵乳制品中分离得到的乳杆菌为研究对象，扩增并标记靶基因，优化基因芯片检测方法和条件，建立并完善适合乳杆菌分子分类鉴定的高通量的基因芯片。通过芯片杂交、数据分析以确定每株乳杆菌的属种，与传统分类鉴定结果进行比较，并分析采用基因芯片技术对乳杆菌分类鉴定的可靠性和可行性。通过这一研究，在分子水平上建立一套准确、快速、高通量的乳杆菌分类和鉴定技术与平台，同时初步建立我国传统发酵乳制品中乳酸菌的基因数据库，为我国乳酸菌资源的开发、利用及及乳酸菌资源库的建设奠定基础。