人体乳酸菌物种多样性分布模式及其形成机制的研究

乳酸菌是分布在人的口腔、胃肠道以及阴道的重要益生菌，它具有改善人体微生态平衡、预防感染、促进人体自身免疫力的形成等重要生理功能。最新研究表明人体不同部位微环境时空水平的异质性决定了其共生微生物多样性变化规律。然而，人体乳酸菌物种多样性的时空分布规律仍不清楚。因此，本项目将围绕"物种多样性分布模式及其形成机制"这一重大科学问题，从系统论的角度出发，利用比较宏基因组的方法和最新的二代测序技术（454-Presequencing-Barcoding技术），开展以下两方面的研究：①分析人体乳酸菌物种多样性的空间分布（口腔、胃肠道和阴道）规律，特别是不同肠道部位；②分析人体乳酸菌物种多样性的时间分布规律，即育龄女性月经周期不同阶段阴道乳酸菌物种多样性变化规律及其与性激素变化的相关性。本项目为今后进一步探讨人体乳酸菌适应不同生境的分子机制提供一定的理论支持，且在未来促进人体健康方面具有潜在的指导作用。

本项目严格按计划进行，超额完成既定研究目标，于项目执行期间先后在国际著名SCI杂志《ISME Journal》、《Am J Gastroenterol》、《BMC Genomics》上发表研究论文各1篇，在《Gut Pathogens》发表研究论文2篇,累计影响因子超过26，目前总计被引用28次。. 项目执行期间，人体不同部位乳酸菌的分布的模式已经有所报道，本项目着重通过对健康人群肠道不同部位微生物多样性的研究（包括乳酸菌），在理论上，更加全面地认识和理解肠道微生物空间分布模式；在应用上，揭示了与几种疾病相关肠道微生物紊乱，特别是疾病发生相关特异微生物的鉴定，在肠道疾病诊断和治疗上具有潜在的应用价值。