基于结构域组成变换的蛋白质相互作用预测方法研究

蛋白质相互作用是当前蛋白质组学所要解决的关键问题之一，这个问题的解决有助于理解生命现象的本质，并对整个生命科学的发展都将起到强有力的推动作用。近几年利用计算方法预测蛋白质相互作用受到了广泛关注并得到了快速发展，但还没有一种方法能够同时考虑多结构域之间复制和组合对蛋白质相互作用所产生的影响。本项目在蛋白质相互作用的数据获取和预处理、特征提取和选择、分类识别方面进行深入研究，探索蛋白质相互作用的作用机制；从蛋白质－结构域出发，提出一种新的基于结构域组成的蛋白质柱状编码方式，构建预测蛋白质相互作用的高性能计算模型；考虑多结构域对蛋白质相互作用的影响，对结构域组成进行非线性变换，并利用进化算法优化计算模型，为得到高可靠性的蛋白质相互作用预测结果打下良好的基础。本项目的成果将为了解蛋白质生理功能的实现机制和治疗相关疾病的药物设计提供理论上的依据。