Graves'病关联区域候选基因深度测序及致病变异的鉴定

Graves'病(GD)是一种遗传与环境共同起作用导致的器官特异性自身免疫性疾病。课题组前期完成了中国人群GD 的全基因组关联研究(GWAS)，结果验证了报道的四个关联区域，并发现和验证三个新的关联区域。然而，这些覆盖着多个易感基因的关联区域由于存在着强的连锁不平衡，目前的数据不能判定真正的易感基因；另外，已发现的这些常见变异只能对GD遗传机制的一小部分做出解释，未被发现的罕见变异可能对GD的易感性也起到重要的作用。新一代测序技术的发展，使得鉴定这些易感区域内的致病基因和探讨罕见变异对常见疾病的影响成为可能。本课题拟利用新一代的测序技术454 GS FLX系统，在病例对照样本中对GWAS发现的易感区域内的候选基因进行深度测序，并对发现的变异进行关联分析；阳性结果在独立的大样本中进行验证，鉴定易感基因和变异；利用生物信息学和分子生物学手段，阐述疾病相关的遗传变异影响疾病发生的生物学机制。

Graves'病(GD)是一种遗传与环境共同起作用导致的器官特异性自身免疫性疾病。课题组前期完成了中国人群GD 的全基因组关联研究(GWAS)，结果验证了报道的四个关联区域，并发现和验证三个新的关联区域。然而，这些覆盖着多个易感基因的关联区域由于存在着强的连锁不平衡，目前的数据不能判定真正的易感基因；另外，已发现的这些常见变异只能对GD 遗传机制的一小部分做出解释，未被发现的罕见变异可能对GD 的易感性也起到重要的作用。新一代测序技术的发展，使得鉴定这些易感区域内的致病基因和探讨罕见变异对常见疾病的影响成为可能。本课题利用新一代的测序技术，在病例对照样本中对GWAS 发现的易感区域内的候选基因和一些功能候选基因进行深度测序，并对发现的变异进行关联分析；阳性结果在独立的大样本中进行验证，鉴定易感基因和变异；利用生物信息学和分子生物学手段，阐述疾病相关的遗传变异影响疾病发生的生物学机制。 .结果显示X染色体上GPR174基因上的罕见突变也与疾病的易感性相关（P = 1.16×10-3）。基因表达研究显示GPR174基因广泛的表达于免疫相关的组织，rs3827440基因型与GPR174基因的表达水平相关(P = 0.002)。GPR174基因在男女之间不存在表达差异。甲状腺球蛋白基因（Tg）上存在两个影响疾病的易感性的罕见变异，这两个变异以前没有被发现，分别改变氨基酸编码K929Q和S2419Y。在正常人群中的频率极低（MAF=0.46%和MAF=0.73%），而在患者中的频率为2.6%和1.2%。两者皆与Graves’病相关（P=3.92×10-7和P=1.28 ×10-5）。我们的研究结果提示作用较小的常见变异和作用较大的罕见变异共同影响了GD的易感性。