预测浅表性膀胱癌术后进展的两基因分子诊断模型的建立及其应用研究

基本信息
批准号:81071787
项目类别:面上项目
资助金额:31.00
负责人:王海涛
学科分类:
依托单位:天津医科大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:AikChoonTan,李晓青,任丽,邹强,徐彦,杨茂,刘明
关键词:
膀胱癌分类器分子预后诊断模型KTSP算法
结项摘要

早期精确预测肿瘤进展风险是浅表性膀胱癌临床工作中面临的重要课题,也是选择及时合理的治疗方案、降低死亡率、提高患者生活质量的关键所在。本项目基于膀胱癌两类遗传通路理论,采用基因芯片技术检测了40例包含3年以上完整随访资料的浅表性膀胱癌组织,获得了3年内未发生肿瘤进展与肿瘤进展的膀胱癌之间的基因表达谱。根据获得的芯片数据,采用新型生物信息学算法K-TSP构建仅有两个基因组成的分子诊断模型,进而采用留一法和独立样本验证该模型的诊断性能,最后进一步采用荧光定量RT-PCR和定量免疫组化方法分别在癌组织及尿脱落细胞中检测两基因的相对表达水平并应用ROC曲线分析该模型的诊断价值,为临床上实现膀胱癌的个体化治疗提供理论依据与实践基础。如能取得预期成果,所建立的两基因分子诊断模型在临床大样本及随访病例中进行验证,这一简便易行的分子诊断模型应用于临床检测的时间不会太久,前景广阔。

项目摘要

早期精确预测肿瘤进展风险是浅表性膀胱癌临床工作中面临的重要课题,也是选择及时合理的治疗方案、降低死亡率、提高患者生活质量的关键所在。本项目基于膀胱癌两类遗传通路理论,采用基因芯片技术检测了40例包含3年以上完整随访资料的浅表性膀胱癌组织,获得了3年内未发生肿瘤进展与肿瘤进展的膀胱癌之间的基因表达谱。根据获得的芯片数据,采用新型生物信息学算法K-TSP构建仅有两个基因组成的分子诊断模型,进而采用定量 RT-PCR 和定量免疫组化方法在癌组织中检测两基因的相对表达水平并应用ROC曲线分析该模型的诊断价值。结果发现,(1)完成了预测表浅膀胱癌进展的基因表达谱分析,为下一步生物信息学分析奠定了基础;(2)采用两基因分类器算法K-TSP构建两基因分子诊断模型,可早期精确预测浅表性膀胱癌TURBT治疗后进展风险;(3)定量RT-PCR和免疫组化检测癌组织中两基因相对表达水平及ROC曲线诊断性能分析显示,Fibronectin 1和YWHAE两基因分子诊断模型具有较高的诊断价值; (4) 应用反义核酸技术阻断YWHAE基因在膀胱癌EJ细胞中的表达,结果显示,YWHAE基因是跟膀胱癌发生发展密切相关的新基因,它的表达与膀胱癌细胞的生长、增殖、抗凋亡密切相关,值得深入研究。这些研究结果提示,Fibronectin 1和YWHAE两基因分子诊断模型具有较高的诊断价值,可早期精确预测肿瘤进展风险,YWHAE基因是跟膀胱癌发生发展密切相关的新基因,它的表达与膀胱癌细胞的生长、增殖、抗凋亡密切相关。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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