足细胞分子编码基因拷贝数变异在激素耐药肾病的参与作用

基本信息
批准号:81100504
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:23.00
负责人:李建国
学科分类:
依托单位:首都儿科研究所
批准年份:2011
结题年份:2014
起止时间:2012-01-01 - 2014-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:曹力,陈晓丽,陈朝英,季丽娜,林甜甜,王珍,李华荣,耿海云
关键词:
拷贝数变异激素耐药肾病足细胞分子
结项摘要

儿童肾病综合征根据药物疗效主要分为激素敏感和激素耐药型,前者预后相对好,后者预后差。从致病机制上讲前者主要为免疫机制,后者中约20%的患儿是由于肾小球滤过屏障上的足细胞分子编码基因突变所致。但是,仍有80%的激素耐药肾病患儿的致病机制不清楚。基因组拷贝数变异(CNVs)可以通过影响基因表达造成人群对疾病的易感性及药物的反应性。对于激素耐药肾病,是否存在足细胞分子编码基因CNVs影响了足细胞分子功能而致病,目前尚不清楚。本课题对足细胞分子编码基因CNVs与激素耐药、激素敏感肾病及正常儿童进行关联分析,以期发现与激素耐药肾病相关的CNVs,进一步分析目的CNVs的生物信息学及不同拷贝数对外周血及肾组织相关基因表达水平、足细胞分子网络表达的影响,以探索其参与激素耐药的分子机制。该研究对于预测药物反应及指导治疗具有重要的临床价值,对于阐明激素耐药的机制及探索药物治疗的分子靶点又具有潜在科研价值。

项目摘要

研究发现部分SRNS是由于肾小球滤过屏障上的足细胞分子编码基因突变所致。本课题对与SRNS相关致病基因进行研究,第1个阶段采用PCR法对常见已知基因进行分析;第2阶段收集与SRNS相关的致病基因、位于肾小球滤过屏障上的蛋白分子编码基因,之相互作用的分子、信号转导分子等,一共确定339个基因,采用目标区域靶向捕获再测序的技术进行分析。其中SRNS组30例,激素敏感肾病组33例,正常对照组27例纳入该研究。采用3个软件进行分析,分析结果分为D(Deleterious),P(Probably_damaging),T(Tolerated),B(Benign)。.第一部分-已知基因分析:(1)检出4例与SRNS相关的致病性基因,NPHS1、NPHS2、WT1、PLCE1各1例,突变检出率为13.3%,在激素联合免疫抑制剂治疗尿蛋白始终未缓解的患儿中,突变检出率为27.3%。(2)在SRNS组检出46种单核苷酸多态性(SNP),其中NPHS1基因349G>A和1763A>G的等位基因频率在SRNS组和激素敏感肾病组患儿中的分布具有统计学差异(P<0.05),提示患儿携带这两个位点可能预示临床对激素耐药。(3)在1例SRNS男性患者发现COL4A5(c.2677+1G>A)罕见变异,提示在SRNS中同样可能有COL4A5基因突变。.第二部分-潜在致病基因探索:(1)与SRNS可能相关的新致病基因:1、PLCH1:编码蛋白具有磷脂酶C活性,1例SRNS患者携带PLCH1罕见复合杂和突变,两个位点的软件预测均为DPP,提示具有致病性。2、HP基因:在1例SRNS病例中发现HP基因变异(960G>C,Hom),三种预测结果分别为TPP,氨基酸性质发生改变,提示其致病性。3、RHOXF2B基因:定位于X染色体,1例男性SRNS患儿携带罕见变异(c.C398T,p.A133V),软件预测为DPB。4、MAGI-1:发现1例患者携带MAGI-1罕见变异,MAGI-1在足细胞功能完整方面起重要作用,推测MAGI-1基因可能是SRNS的新致病基因。(2)与SRNS相关的基因位点:在SRNS组确定与SRNS相关的高度可疑突变位点74个。(3)基因CNVs:在chrX:153577207-153599623区域激素敏感为拷贝数增加,而SRNS为拷贝数缺失。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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