食管癌是我国高发的恶性肿瘤,是高致死性的复杂疾病。miRNA是基因表达调控的重要环节,主要通过与靶基因的3'UTR结合而调控基因表达,与肿瘤的发生和发展密切相关。基因miRNA结合位点的SNP可能改变其对靶基因的调控功能,影响肿瘤易感性,从而为我们开展食管癌候选基因关联分析提供了一条新思路。本项目在已建立散发性食管癌样本资源库和前期研究的基础上,选择与食管癌发病相关的多个肿瘤基因和代谢酶基因,利用生物信息学发掘相关基因3'UTR中miRNA结合位点的SNP。基于病例-对照设计,采用SNPlex技术进行大样本基因分型,并从单位点分析、位点-环境互作分析、多位点联合作用分析方面,探讨miRNA结合位点SNP与散发性食管癌的关联性,发掘食管癌易感的SNP,并对风险SNP位点进行功能研究。进一步加深对食管癌病因和发病机制的认识,寻找新的诊断和治疗靶点,为提高食管癌的防治水平提供新的依据。
本研究项目的结果包括三方面内容:1、筛选出与食管癌发病相关的基因以及与环境致癌物质代谢相关的基因,通过生物信息学方法,预测和筛选出相关基因3’UTR miRNA结合位点的SNP。2、采用病例对照的设计思路,在中国重庆地区人群中揭示miRNA结合位点多态性与散发性食管癌发生的关联,发现食管癌的易感遗传标记,以期应用于食管癌风险预测。其中pre-miRNA的多态性位点(pre-miR-146a的rs2910164和pre-miR-196-a2的rs11614913),Bax、DCR3-1, DCR3-2启动子区SNPs等多态位点与中国汉族人群食管癌存在显著的相关性。MMP2,MMP8等相关基因的SNP位点与吸烟存在交互作用共同参与了食管癌的发生发展。3、通过对阳性SNP位点RAP1A rs6573进行功能研究,进一步发现SNP rs6573可以影响miR-196a对RAP1A的表达调控,从而参与了食管癌的转移。. 本项目的研究意义:在本项研究中,我们通过生物信息学预测,完成其它食管癌相关的肿瘤基因及代谢酶基因3’UTR miRNA结合位点的SNP筛选。利用已建立的食管癌临床数据库和DNA样本数据库,基于病例-对照的设计思路,采用SNPlex技术进行大样本SNP位点分型扫描。并从单位点分析、位点-环境互作分析、多位点联合作用分析等几个方面,探讨miRNA结合位点SNP与散发性食管癌的关联性。发掘食管癌易感的SNPs,并对风险SNP位点进行功能研究。加深对食管癌病因和发病机制的认识,寻找新的诊断和治疗靶点,为提高食管癌的防治水平提供新的依据。. 本项目取得的成果:到目前为止已发表发表国外SCI论文7篇,国内1篇。培养博士5名,硕士1名。
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数据更新时间:2023-05-31
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