深度挖掘杆状病毒蛋白质互作网络

Baculovirus, which can specifically infect insects, plays important roles in suppressing the growth and development of insects. Therefore, it is promising to be used as biopesticide and is of important applied value to be developed as the vectors of eukaryotic expression system and gene therapy. Baculovirus is a kind of double stranded DNA virus, the genome of which contains numerous viral proteins and constitutes complicated protein-protein interaction (PPI) network. To date, knowledge about baculovirus PPI and baculovirus-insects PPI and infection mechanisms are still limited, which restricted the development of genetic improvement and application of baculoviruses in the fields related to genetic engineering techniques. This study will analyse the omics data from baculoviruses, establish a new algorithm of correlation analysis to resolve the baculovirus genetic information including nucleotides and proteins, and at the same time employ previously reported bioinformatic methods for the PPI analyses to further reveal the baculovirus-insects PPI network. The efficacy of established algorithm will be evaluated, while the baculovirus-insects PPIs will be determined by biological experiments. The outcomes from this study will propose a new algorithm of correlation analysis of PPIs and further reveal the baculovirus PPI network, which will provide very important bioinformatic data for the better understanding of the molecular mechanisms of baculovirus infection and replication.

杆状病毒是一类特异性感染昆虫的病原体，在抑制多种昆虫的生长发育过程中发挥着重要的作用，在生物防治领域有重要应用前景，在重组蛋白的真核表达和基因治疗方面亦有重要的应用价值。杆状病毒是一类双链大DNA病毒，基因组编码蛋白较多，蛋白质间及其宿主间相互作用机制复杂，目前对杆状病毒蛋白互作网络及感染机理的认识并不完整，制约了杆状病毒基因工程的遗传改良和应用发展。本项目将对多种杆状病毒组学数据进行分析，通过建立关联分析的新算法来研究核酸、蛋白质等遗传信息，同时集成已报道的多种蛋白质互作的生物信息学方法，深入揭示杆状病毒蛋白质互作网络；并将通过生物学实验验证关联分析方法的有效性，鉴定杆状病毒蛋白质间及其宿主蛋白质间的互作。本项目的研究成果将提出分析蛋白互作的新算法，揭示杆状病毒蛋白相互作用网络，为深入理解杆状病毒的感染复制的分子机制提供重要的信息学数据基础。

杆状病毒是一类特异性感染昆虫的病原体，在抑制多种昆虫的生长发育过程中发挥着重要的作用，在生物防治领域有重要应用前景，在重组蛋白的真核表达和基因治疗方面亦有重要的应用价值。杆状病毒是一类双链大DNA病毒，基因组编码蛋白较多，蛋白质间及其宿主间相互作用机制复杂，目前对杆状病毒蛋白互作网络及感染机理的认识并不完整，制约了杆状病毒基因工程的遗传改良和应用发展。本项目将对多种杆状病毒组学数据进行分析，通过建立关联分析的新算法来研究核酸、蛋白质等遗传信息，同时集成已报道的多种蛋白质互作的生物信息学方法，深入揭示杆状病毒蛋白质互作网络；并将通过生物学实验验证关联分析方法的有效性，鉴定杆状病毒蛋白质间及其宿主蛋白质间的互作。本项目的研究成果将提出分析蛋白互作的新算法，揭示杆状病毒蛋白相互作用网络，为深入理解杆状病毒的感染复制的分子机制提供重要的信息学数据基础。