DNA糖苷酶催化N-糖苷键水解机理与酶活性调控分子机制的理论研究

基本信息
批准号:20873105
项目类别:面上项目
资助金额:40.00
负责人:曹泽星
学科分类:
依托单位:厦门大学
批准年份:2008
结题年份:2011
起止时间:2009-01-01 - 2011-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:谢湖均,巫瑞波,唐绍彬,裘云锋
关键词:
组合QM/MM计算N糖苷键水解DNA糖苷酶分子动力学模拟
结项摘要

DNA糖苷酶是一类重要的生物酶,负责催化N-糖苷键的水解裂分生成含氮碱和戊糖,在DNA糖基转移和受损DNA碱基修复过程中起着至关重要的作用。本项目旨在应用组合QM/MM计算方法与组合QM/MM动力学模拟方法,系统地研究脱氧假尿嘧啶抑制UDG糖苷酶催化活性的结构与动力学本质、核苷水解酶IAG-NH和IU-NH催化N-糖苷键水解的解离机理;探索糖苷酶活性位的结构特征、酶与底物和抑制剂的相互作用、保守残基作用的分子机制、蛋白质动力学对酶活性的影响;预测底物和活性区重要残基结构修饰对酶催化活性的调控作用.通过组合QM/MM动力学模拟方法的进一步完善与发展,拓展理论与计算化学到生物体系的应用,为进一步的化学生物学和结构生物学研究提供依据。

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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