甘肃金鳟生长性状候选基因的关联分析及功能标记开发

培育出优质、高产、高效的新品种是保障养殖业可持续发展的关键。甘肃金鳟是以虹鳟（Oncorhynchus mykiss）的突变体选育而成的优良品种，在前期研究中我们对甘肃金鳟核心种质群体进行了遗传评价，分析了该群体在全基因组上的遗传连锁不平衡情况。本项目拟在已有研究基础上，选择生长轴上重要功能基因（GH、IGF-I、IGF-II、GHRH、PACAP和Ghrelin），针对候选基因区段进行基因分型，挖掘其多态性并和生长性状进行关联分析，探明对生长性状有显著影响的功能多态位点，分析组合效应，明晰相关基因等位变异的遗传效应，开发功能标记；在其核心种质资源中挖掘优异等位变异，筛选优势亲本为育种服务，验证标记的功能；测序分析多态类型，阐明候选基因结构变异，结合相关基因结构和调控元件研究，分析功能位点突变引起生长性状改变的作用机理。为通过分子标记辅助选择快速改良甘肃金鳟生长性状提供理论依据和技术支撑。

针对甘肃金鳟关联分析研究，本项目利用甘肃金鳟315尾个体进行了生长性状测量和四个生长功能候选基因的SNP变异基因型分析。生长表型调查结果初步构建了甘肃金鳟生长性状的表型数据库，对各性状的影响大小进行剖析，明确影响甘肃金鳟体重的主要形态性状；基因型分析调查了四个生长功能候选基因（GH, Ghrelin, PACAP, IGF）的SNP变异多态性，研究表明这四个基因在进化过程中都受到了选择压力，但变异程度并不高，另外，基因内含子区变异高于外显子区。结合315尾个体的生长性状关联分析结果发掘了四个基因的生长功能SNP变异位点。研究结果丰富了生长发育遗传育种基础理论并极大地推动甘肃金鳟生长功能标记辅助育种走向实际化。