骨质疏松性骨折重要候选基因的关联研究

基本信息
批准号:30900810
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:20.00
负责人:谭丽君
学科分类:
依托单位:湖南师范大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:文霆,李曦,刘山林,尹芳,刘权威,骆毅
关键词:
关联分析骨质疏松性骨折候选基因基因基因相互作用
结项摘要

申请者前期采用全基因组关联(GWA)研究发现3个新基因ALDH7A1、UBR3、 PHACTR3增加骨质疏松性骨折(OF)的风险,同时,两项国际最新GWA研究发现5个重要基因LRP5、OPG、RANK、LRP4和ZBTB40与白人OF关联。为了进一步验证申请者前期鉴定的3个新基因和在较大的样本中检测5个与白人OF关联的基因与中国人群OF的关联关系,本研究拟在600个髋部骨折样本和600个健康对照样本中,对8个候选基因进行SNP分型,然后采用关联分析检测候选基因与髋部OF的关联关系,同时采用广义多因子降维法(GMDR)分析这8个基因之间的相互作用对OF风险的影响。本研究的完成在理论上可确定这些候选基因与中国人群OF的关系,为下一步开展候选基因的功能研究提供依据;有助于更全面地阐明OF的分子遗传机理。研究结果有望为临床预防和治疗指明新的方向。

项目摘要

本项目基于申请者前期采用全基因组关联(GWA)研究发现的3个与骨质疏松性骨折关联新基因ALDH7A1、UBR3、PHACTR3和两项国际最新GWA研究发现5个重要骨质疏松性骨折候选基因LRP5、OPG、RANK、LRP4 和ZBTB40,在600个髋部骨折样本和600个健康对照样本中对这8个候选基因进行SNP分型,然后采用关联分析检测候选基因与髋部OF的关联关系, 成功验证了ALDH7A1基因的rs13182402与骨折存在关联关系(P = 0.011),风险等位基因G的优势比OR值为1.66,即携带风险等位基因 G 的个体发生骨折的风险是未携带等位基因 G 的个体的 1.66 倍。由于没有检测到其他基因与骨折的关联信号,本研究继续探讨8个候选基因是否与骨密度存在关联关系。对1620个正常中国人样本进行基因分型,并利用Tulane University提供的2286个美国高加索人群数据,检测这8个候选基因与骨密度的关联关系,发现ZBTB40、PHACTR3和LRP5基因内多个SNPs与腰椎和髋部骨密度存在关联。本项目可靠地确定了ALDH7A1、ZBTB40、PHACTR3和LRP5四个基因在中国人群骨质疏松发病机理中的重要作用,而其他四个基因UBR3、OPG、RANK、LRP4在骨质疏松发病机理中的作用还有待进一步研究。本研究的研究结果为下一步开展候选基因的功能研究提供依据;为临床预防和治疗指明新的方向。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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