SYK基因多态性及环境与缺血性脑卒中风险关系的分子流行病学研究

In our previous study, we found rs2290890 of SYK gene could decrease the risk of ischemic stroke for Chinese Han population by Exome sequencing. SYK may influence the risk of ischemic stroke (IS) by immunity, inflammatory response and thrombogenesis. The present study plans to explore and identify the association of SYK polymorphisms with IS by MALDI-TOF, GeXP-Genetic and TaqMan SNP genotyping assays based on two independent case-control studies. A structured questionnaire is used to collect the epidemiological information including smoking, alcohol drinking, diet, obesity, negative events and other environmental risk factors. Dual luciferase reporter assays and QRT-PCR are further carried out to determinate the effects of the significant SNPs. Finally, a comprehensive analysis is performed to demonstrate the associations of gene polymorphisms, haplotype, gene-environment interaction with IS and a predictive model is constructed to identify the individuals with high risk of IS. The current study is expected to shed light on the association of SYK gene and environment with the susceptibility of IS, which would provide scientific research rules for identifying genetic biomarkers and taking preventive steps for the high-risk groups.

课题组前期通过全基因组外显子扫描技术发现并确定SYK基因rs2290890突变等位基因可以降低中国汉族人群缺血性脑卒中的发病风险。SYK基因可能通过影响机体自身免疫、炎症、血栓形成等作用对缺血性脑卒中的发生起到重要调节作用。本研究经两项独立的病例-对照研究，通过问卷调查和病案获取研究对象流行病学信息和临床检测结果；运用测序技术和生物信息学手段选择标签SNPs，再利用飞行质谱、TaqMan探针技术检测和确定阳性SNPs；荧光素酶报告基因方法和QRT-PCR对阳性SNPs开展功能研究；进而综合评价SYK基因多态性、单体型、基因-环境间交互作用对缺血性脑卒中的影响。本课题是国际上首次探讨SYK基因与缺血性脑卒中的关联性，将为缺血性脑卒中易感生物标志物的研究及早期高危个体的识别与特异性干预措施的制定提供科学依据。

缺血性脑卒中是由环境因素和遗传因素及环境-遗传交互作用引起的复杂性疾病，遗传因素是缺血性脑卒中发生和发展中不容忽视的重要部分，双胞胎以及家族聚集性研究都证实遗传因素在缺血性脑卒中发病中有重要影响。近年来研究已经显示Syk基因在粥样硬化斑块形成、血小板激活和集聚方面起关键性作用。但是到目前为止，关于该基因多态性和疾病关联性研究却极少见报道。课题组前期通过外显子测序筛选缺血性脑卒中易感基因位点的过程中发现Syk基因rs2290890多态性与中国汉族人群缺血性脑卒中发病风险有关，P值为4.55 x 10-7，系国际上首次报道。在此基础上，我们结合Syk基因功能，将研究聚焦到Syk基因，我们在100对缺血性脑卒中病例-对照中通过目标基因功能区域测序的方法发现有明显差异的SNP位点，再通过两个独立的病例-对照研究，合计1394例病例和1384例对照中加以验证。研究结果显示rs2290890、rs2306040和rs1049164基因多态性均与中国汉族人群缺血性脑卒中发病风险有关。rs2306040突变等位基因可以增加缺血性脑卒中发病风险（OR=1.23, 95%CI：1.08-1.39，P=0.001), 突变基因型可以明显增加男性的发病风险，OR值为1.82（95%CI：1.08-3.06）；rs1049164突变等位基因可以增加缺血性脑卒中发病风险（OR=1.24，95%CI：1.02-1.52，P=0.035），突变基因型携带者发病风险更加明显，OR值为2.58（95%CI：1.37-4.85），而在 >59岁的男性中这种风险关系更加明显；rs2290890突变等位基因可以增加缺血性脑卒中发病风险，OR值为1.36 (95%CI：1.12-1.67)。通过本研究发现Syk基因多态性可以一定程度影响中国汉族人群缺血性脑卒中发病风险，这种风险关系在男性中尤其明显，同时rs2306040和rs1049164间存在交互作用关系。本研究为缺血性脑卒中遗传易感性提供了新的研究热点，弥补了Syk基因多态性和疾病关联性研究的空白。