一种新型琼胶酶AgaB的晶体结构与催化机制研究

AgaB来源于假别单胞菌CY24，是一个结构与功能全新的琼胶酶。它的酶学性质特异，降解琼脂糖的主要终产物是新八琼糖和新十琼糖，其催化腔至少能容纳十二个糖单元，是目前所发现的催化腔最大的一种琼胶酶。另外，一维氢谱NMR分析表明：该酶通过异头碳构型翻转机理来催化水解糖苷键，与其他琼胶酶经异头碳构型保持的催化机理迥异。本项目拟以AgaB为研究对象，通过对其发酵条件、宿主菌等因素的优化，建立一个简洁、高效和廉价的产业化生产琼胶酶的工程菌株。在此基础上，本项目将测定AgaB的晶体结构以及其与产物的复合物晶体结构，并结合定点突变、酶学测定等手段阐释这一新颖琼胶酶的催化机制，为深入了解和合理开发利用此类琼胶酶奠定结构基础。