转录因子结合位点(TFBS)研究

基本信息
批准号:30570425
项目类别:面上项目
资助金额:28.00
负责人:邓明华
学科分类:
依托单位:北京大学
批准年份:2005
结题年份:2008
起止时间:2006-01-01 - 2008-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:江洪,冯秀程,严熙婷,俞欢,万林,张玉萍,裴国军,谈效俊,李明
关键词:
转录因子结合位点(TFBS)基因表达分子进化系统生物学启动
结项摘要

本项目进行转录因子结合位点(TFBS)的序列分析。旨在发展一套概率模型,发掘TFBS位点间的相关性,从模型上克服位置特异打分矩阵(PSSM)在TFBS描述上的局限性,同时融合多个物种启动子序列上的分子进化模型,给出高精度的TFBS检测算法。在转录因子结合位点预测的基础上,研究基因调控序列与基因表达水平的关系,建立基因表达水平预测的系统生物学模型,探索基因调控机制。在转录因子结合位点预测的基础上,分析调控区域的分子进化规律以及TFBS在基因启动子区域上的分布规律,建立启动子预测模型,对拟兰芥、水稻等基因组进行启动子标注,为其功能基因组研究提供基础。

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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