IGF1-FoxO通路与猪生长发育性状间的关联分析研究

基本信息
批准号:31072003
项目类别:面上项目
资助金额:36.00
负责人:潘玉春
学科分类:
依托单位:上海交通大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王起山,张向喆,王明辉,何侃,陈强,杨帆
关键词:
IGF关联分析生长发育FoxOpanthway
结项摘要

猪的生长发育影响增重速度、饲料转化效率及胴体组成等诸多性状,因而揭示其内在的分子遗传机制具有重要意义。然而,全基因组扫描、候选基因分析以及全基因组关联分析等可以找出影响数量性状的DNA片段(QTL)或SNP位点,但不能反映从基因到性状的生物学过程。为此,本项目拟开展下列工作:一是通过基因芯片的元分析和文献挖掘等分析模式生物IGF1-FoxO通路的组成、结构及功能;二是以IGF1-FoxO通路作为影响猪生长发育的候选通路,依据猪基因组序列、已有QTL和基因及克隆等手段,得到猪IGF1-FoxO通路的基因、序列,并定制SNP检测芯片;三是提出一种基于整个通路,既检测关联基因与多态又兼顾生物学解释的候选通路关联分析方法;四是进行猪的生长发育、屠宰及肉质分析试验,进而探讨IGF1-FoxO通路与有关性状间的关系。显然,这一研究将丰富有关理论,并有助于真正从通路水平上揭示猪的生长发育机制。

项目摘要

猪的生长发育影响增重速度、饲料转化效率及胴体组成等诸多性状,因而揭示其内在的分子遗传机制具有重要意义。本项目开展了下列工作:一是运用基因芯片的元分析和文献挖掘等分析方法分析了模式生物IGF1-FoxO通路的组成、结构及功能;二是以IGF1-FoxO通路作为影响猪生长发育的候选通路,依据猪基因组序列和已有QTL注释等信息,得到了猪IGF1-FoxO通路的基因、序列,并定制SNaPshot检测芯片;三是提出了一种基于整个通路,既检测关联基因多态又兼顾生物学解释的候选通路关联分析方法;四是进行了猪的生长发育、屠宰及肉质分析试验,运用SNaPshot检测芯片和提出的新的关联分析方法,深入研究了IGF1-FoxO通路与有关性状间的关系。本研究为从通路水平上揭示猪的生长发育机制和基于通路分子标记的猪的遗传改良奠定了基础。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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