复杂疾病的基因表达谱与蛋白质互作网络的功能模块化分析

在本课题中进一步研究结合基因表达谱与蛋白质互作网络信息的系统生物学分析技术:（1）完善可操作的具备不同生物学意义的"特征功能模块"的定义与稳健的识别算法。根据基因功能分类体系GO的生物通路和亚细胞定位等信息，寻找亚细胞位置特异复合功能类等作为特征功能模块。（2）动态整合基因功能知识，发展基于"基因功能模块表达谱"的疾病分型技术，包括有监督的疾病预测与无监督的疾病新亚型识别，并以特征表达调控网络解析疾病分型的"功能模块化"协同机制。（3）结合基因表达信息解析蛋白质互作网络，识别条件特异应答子网，发现其功能模块化组织关系。（4）结合基因表达谱与蛋白质互作网络，发展基于实验条件相关功能模块的基因功能预测算法。（5）应用于发现前列腺癌、乳腺癌、心率失常等复杂疾病的机制。从"功能模块表达谱"出发进行知识发现，为癌症等复杂疾病的分型与机理研究、疾病相关特征基因发现与功能预测提供有突破意义的新途径。