复杂疾病miRNA多态风险位点识别及其生物学功能分析

miRNA多态miRSNPs的出现对miRNA的功能研究产生重要影响。随着对复杂疾病研究的深入，miRSNPs在疾病发生中的重要作用为人们越来越重视，因此，如何研究鲁棒的信息学方法识别miRSNPs，并研究其功能意义及与复杂疾病发生发展的密切关系是一项极为重要的工作，具有紧迫性和重要的现实意义。本课题致力于整合dbSNP中的SNP数据、疾病相关SNP数据和多类miRNA靶点数据，识别候选的导致疾病或与疾病发生发展密切相关的miRSNPs，研究不同类型miRSNPs的分子生物学功能，研究miRSNPs引起miRNA功能失调从而导致疾病发生的机制，并以结肠癌、前列腺癌、胃癌等疾病的数据为例，证实miRSNPs在病理研究中的重要性及其功能，预期研究成果为将指导疾病的病因学和病理学研究，为疾病靶向治疗提供可靠的理论依据，具有潜在的社会效益和经济价值。

本项目按原计划完成。在本项目中，我们系统地整合了miRNA及靶点数据、当前已知的疾病相关SNP数据和dbSNP中的SNP数据，识别了候选的致病或与疾病发生发展密切相关的miRNA多态 (miRNAs polymorphisms, miRSNPs)，我们开发了基于高通量数据和功能组学数据的方法研究不同类型miRSNPs的分子生物学功能，以及这些miRSNPs引起miRNA功能失调进而导致疾病发生的机制；此外，我们还进一步扩展了本研究工作，识别了人类长链非编码RNA (large intergenic non-coding RNA, lincRNA)上的疾病相关多态(lincSNPs)，并系统剖析了lincRNA上的多态分布特征，识别出了lincRNA上的功能区域，同时建立了人类lincRNA相关的疾病SNP数据库(LincSNP)和lincRNA转录因子结合位点多态数据库（SNP@lincTFBS）。本项目共发表SCI论文22篇，研究论文发表在国外著名生命科学杂志《Nucleic Acids Research》、《Bioinformatics》、《BMC System Biology》和《Gene》等杂志上。更重要的是，我们以结肠癌、前列腺癌等人类常见恶性肿瘤为例，证实了miRSNPs和lincSNPs在肿瘤发生发展中的重要作用和生物功能，研究成果为指导疾病的病因学和病理学研究以及疾病的靶向治疗提供了可靠的理论依据，具有潜在的社会效益和经济价值。