核酸(DNA)大分子的研究是一个典型的多尺度问题,也是联系到数学、物理、化学及生物的典型交叉学科问题。它的宏观构形与其生物功能紧密联系,如何有效的建立核酸的数学模型并进行数值模拟研究其构形的变化是人们一直努力研究的一个重要方向。生物体系中在核酸与蛋白质相互作用的区域处于原子尺度,而超缠结(supercoiling)及弹性现象则是处于宏观尺度。传统的微观模型有着计算量太大的问题,宏观的弹性模型有着过于粗粒化的问题。本研究项目的目的在于发展一个介观尺度的模型,使得其与宏观及微观模型有着自然的联系,实际计算中在不同的区域采用不同尺度的模型达到减少计算量并且尽可能真实的反应物理现象。
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数据更新时间:2023-05-31
DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences
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