SF3B3在膀胱癌中调控ATP2B4异常选择性剪接的研究

基本信息
批准号:81802562
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:21.00
负责人:杨涛
学科分类:
依托单位:长江大学
批准年份:2018
结题年份:2021
起止时间:2019-01-01 - 2021-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:廖义翔,周家杰,曾金敏,刘卫刚,雷毕鹏,袁文泽,董娟
关键词:
机制选择性剪切膀胱肿瘤SF3B3细胞质膜钙ATP酶4
结项摘要

The regulation of alternative splicing is tightly controlled during normal tissue differentiation. The protein isoforms coded by the aberrant splicing mRNA could cause many kinds of diseases including cancer. Until now, like in many other cancers, the function of most aberrant splicing events in bladder cancer is still unknown. ATP2B4 is a member of cell membrane protein family, while the expression and function of ATP2B4 in bladder cancer is unclear. We found an aberrant Exon 21 splicing of ATP2B4 in bladder cancer using bioinformatics and validated this aberrant splicing events with our bladder cancer panel, the expression and function of the two transcript variants was different in tumor/normal bladder tissues. Further investigation preliminary proved the splicing was regulated by SF3B3, but the underlying mechanism remains unknown. So in this project, we plan to fully study the regulation of ATP2B4 aberrant splicing by SF3B3 in bladder cancer, and to further reveal the function and mechanism of ATP2B4 aberrant splicing in bladder cancer. These would help us understand the property of bladder cancer, enrich the molecular biology theory and finally contribute to the prognostic and therapeutic use of targeting aberrant splicing in bladder cancer.

在正常的组织分化过程中选择性剪接的调控是受到严格控制的,但异常的选择性剪接可产生异常蛋白异构体导致包括癌症在内的许多疾病。与其它肿瘤类似,目前人们对于膀胱癌中的异常选择性剪接及相关的剪接因子还了解不多。ATP2B4是细胞表面膜蛋白家族重要成员,其在膀胱癌中的表达及功能尚未见报道。我们通过生物信息学方法发现并在膀胱癌组织中验证ATP2B4存在Exon 21异常剪接,该可变剪接产生的两个转录本在膀胱癌组织/癌旁组织中的分布及对膀胱癌细胞增殖及侵袭能力的影响均有显著差异,进一步研究初步证实了剪接因子SF3B3对该可变剪接的调控,但具体的作用机制尚不清楚。本项目拟在现有工作基础上,深入探究膀胱癌中SF3B3调控ATP2B4异常可变剪接的分子机制,明确该异常剪接在膀胱癌细胞中的功能及作用机理。这将有助于我们进一步理解膀胱癌发生、发展的分子机理,并可能为膀胱癌的临床治疗提供新的策略和作用靶点。

项目摘要

在正常的组织分化过程中选择性剪接的调控是受到严格控制的,但异常的选择性剪接 可产生异常蛋白异构体导致包括癌症在内的许多疾病。与其它肿瘤类似,目前人们对于膀 胱癌中的异常选择性剪接及相关的剪接因子还了解不多。ATP2B4是细胞表面膜蛋白家族重 要成员,其在膀胱癌中的表达及功能尚未见报道。我们通过生物信息学方法发现并在膀胱 癌组织中验证ATP2B4存在Exon 21异常剪接,该可变剪接产生的两个转录本在膀胱癌组织及癌旁组织中的分布及对膀胱癌细胞增殖及侵袭能力的影响均有显著差异,V1/V2转录本比值和总生存率及肿瘤无复发生存率相关,比值越高的患者,生存越理想。并在50例样本中进行了验证,半定量检测表明V1/V2转录本比值和临床分级分期相关,比值越低患者临床分期越晚。同时V1/V2转录本比值和SF3B3表达呈负相关,这和干扰SF3B3后V1转录本增多的趋势是相符合的。 相关功能回复实验结果表明干扰SF3B3明显抑制细胞增殖及迁移能力,同时干扰SF3B3并且过表达ATP2B4-V2转录本可以明显逆转干扰SF3B3所导致的细胞增殖及迁移能力的抑制,但是同时过表达ATP2B4-V1转录本确不能逆转该作用。这些研究初步表明SF3B3参与调控ATP2B4的选择性剪切。并且与膀胱癌临床分期及预后相关,具有成为治疗靶标及膀胱癌标志物的潜能。

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

监管的非对称性、盈余管理模式选择与证监会执法效率?

监管的非对称性、盈余管理模式选择与证监会执法效率?

DOI:
发表时间:2016
2

农超对接模式中利益分配问题研究

农超对接模式中利益分配问题研究

DOI:10.16517/j.cnki.cn12-1034/f.2015.03.030
发表时间:2015
3

宁南山区植被恢复模式对土壤主要酶活性、微生物多样性及土壤养分的影响

宁南山区植被恢复模式对土壤主要酶活性、微生物多样性及土壤养分的影响

DOI:10.7606/j.issn.1000-7601.2022.03.25
发表时间:2022
4

基于细粒度词表示的命名实体识别研究

基于细粒度词表示的命名实体识别研究

DOI:10.3969/j.issn.1003-0077.2018.11.009
发表时间:2018
5

视网膜母细胞瘤的治疗研究进展

视网膜母细胞瘤的治疗研究进展

DOI:
发表时间:2018

杨涛的其他基金

批准号:11775178
批准年份:2017
资助金额:56.00
项目类别:面上项目
批准号:81101443
批准年份:2011
资助金额:22.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:81530026
批准年份:2015
资助金额:274.00
项目类别:重点项目
批准号:50376072
批准年份:2003
资助金额:25.00
项目类别:面上项目
批准号:40903002
批准年份:2009
资助金额:19.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:11347025
批准年份:2013
资助金额:20.00
项目类别:专项基金项目
批准号:10304016
批准年份:2003
资助金额:28.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:50571007
批准年份:2005
资助金额:23.00
项目类别:面上项目
批准号:60501012
批准年份:2005
资助金额:24.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:31350005
批准年份:2013
资助金额:10.00
项目类别:专项基金项目
批准号:11601231
批准年份:2016
资助金额:17.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:81372750
批准年份:2013
资助金额:50.00
项目类别:面上项目
批准号:60876033
批准年份:2008
资助金额:40.00
项目类别:面上项目
批准号:60903126
批准年份:2009
资助金额:19.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:61201008
批准年份:2012
资助金额:27.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:51605399
批准年份:2016
资助金额:20.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:11047024
批准年份:2010
资助金额:15.00
项目类别:专项基金项目
批准号:61377019
批准年份:2013
资助金额:80.00
项目类别:面上项目
批准号:61574139
批准年份:2015
资助金额:64.00
项目类别:面上项目
批准号:51105151
批准年份:2011
资助金额:25.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:61106116
批准年份:2011
资助金额:30.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:21473067
批准年份:2014
资助金额:84.00
项目类别:面上项目
批准号:81570930
批准年份:2015
资助金额:57.00
项目类别:面上项目
批准号:91433206
批准年份:2014
资助金额:350.00
项目类别:重大研究计划
批准号:81101895
批准年份:2011
资助金额:20.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:11874151
批准年份:2018
资助金额:64.00
项目类别:面上项目
批准号:30971405
批准年份:2009
资助金额:32.00
项目类别:面上项目
批准号:41573004
批准年份:2015
资助金额:73.00
项目类别:面上项目
批准号:81471895
批准年份:2014
资助金额:72.00
项目类别:面上项目
批准号:71701027
批准年份:2017
资助金额:18.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:30971596
批准年份:2009
资助金额:30.00
项目类别:面上项目
批准号:51902020
批准年份:2019
资助金额:26.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:61176047
批准年份:2011
资助金额:74.00
项目类别:面上项目
批准号:51708192
批准年份:2017
资助金额:23.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:61402373
批准年份:2014
资助金额:25.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:31700215
批准年份:2017
资助金额:24.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:51879068
批准年份:2018
资助金额:60.00
项目类别:面上项目
批准号:41204062
批准年份:2012
资助金额:25.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:81371101
批准年份:2013
资助金额:70.00
项目类别:面上项目
批准号:21675092
批准年份:2016
资助金额:65.00
项目类别:面上项目
批准号:41061036
批准年份:2010
资助金额:26.00
项目类别:地区科学基金项目
批准号:38870008
批准年份:1988
资助金额:2.40
项目类别:面上项目
批准号:41361067
批准年份:2013
资助金额:52.00
项目类别:地区科学基金项目
批准号:11226070
批准年份:2012
资助金额:3.00
项目类别:数学天元基金项目
批准号:31101198
批准年份:2011
资助金额:25.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:30400219
批准年份:2004
资助金额:23.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:61672429
批准年份:2016
资助金额:57.00
项目类别:面上项目
批准号:21764010
批准年份:2017
资助金额:35.00
项目类别:地区科学基金项目
批准号:61076050
批准年份:2010
资助金额:55.00
项目类别:面上项目
批准号:81572518
批准年份:2015
资助金额:50.00
项目类别:面上项目
批准号:40901016
批准年份:2009
资助金额:24.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:51178402
批准年份:2011
资助金额:60.00
项目类别:面上项目
批准号:41874105
批准年份:2018
资助金额:65.00
项目类别:面上项目
批准号:58870332
批准年份:1988
资助金额:3.00
项目类别:面上项目
批准号:41371051
批准年份:2013
资助金额:75.00
项目类别:面上项目
批准号:51702278
批准年份:2017
资助金额:23.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:51568005
批准年份:2015
资助金额:40.00
项目类别:地区科学基金项目
批准号:60972024
批准年份:2009
资助金额:28.00
项目类别:面上项目
批准号:81503499
批准年份:2015
资助金额:18.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:41873011
批准年份:2018
资助金额:60.00
项目类别:面上项目
批准号:11076024
批准年份:2010
资助金额:34.00
项目类别:联合基金项目
批准号:60776043
批准年份:2007
资助金额:7.00
项目类别:面上项目
批准号:50301002
批准年份:2003
资助金额:8.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:41571512
批准年份:2015
资助金额:51.00
项目类别:面上项目
批准号:21566013
批准年份:2015
资助金额:40.00
项目类别:地区科学基金项目
批准号:50808149
批准年份:2008
资助金额:20.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:41476083
批准年份:2014
资助金额:86.00
项目类别:面上项目
批准号:30671010
批准年份:2006
资助金额:30.00
项目类别:面上项目
批准号:21275084
批准年份:2012
资助金额:80.00
项目类别:面上项目
批准号:11372220
批准年份:2013
资助金额:70.00
项目类别:面上项目
批准号:59606010
批准年份:1996
资助金额:10.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:81270897
批准年份:2012
资助金额:120.00
项目类别:面上项目
批准号:81602956
批准年份:2016
资助金额:17.30
项目类别:青年科学基金项目
批准号:61272288
批准年份:2012
资助金额:80.00
项目类别:面上项目
批准号:20805025
批准年份:2008
资助金额:23.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:41472177
批准年份:2014
资助金额:80.00
项目类别:面上项目
批准号:51604116
批准年份:2016
资助金额:20.00
项目类别:青年科学基金项目

相似国自然基金

1

脑MDCs选择性剪接的调控及其在神经发育中的功能研究

批准号:30470974
批准年份:2004
负责人:乔守怡
学科分类:C1204
资助金额:18.00
项目类别:面上项目
2

lncRNA选择性剪接(AS)遗传变异与膀胱癌易感性及其机制研究

批准号:81872691
批准年份:2018
负责人:储海燕
学科分类:H3010
资助金额:57.00
项目类别:面上项目
3

TrkA选择性剪接亚型TrkAⅢ在神经母细胞瘤中剪接机制的研究

批准号:30950021
批准年份:2009
负责人:张继红
学科分类:H1805
资助金额:10.00
项目类别:专项基金项目
4

RBM4调控RNA选择性剪接的机制及其在肿瘤进展中的作用研究

批准号:31471235
批准年份:2014
负责人:汪洋
学科分类:C0602
资助金额:85.00
项目类别:面上项目