新发现的高血压相关标志SNPs功能变异及预测研究

In November of 2015, Nature Genetics, the famous international journal, published the findings of trans-ethnic genetics and replication study of blood pressure phenotypes, in which the study identified 12 new genetic loci at multiple nearby CpG sites influencing blood pressure phenotypes. The proposed study takes advantage of 12 newly identified novel sentinel loci associated with blood pressure, and utilizes cutting-edge next-generation resequencing technology to identify novel functional variants for hypertension in the Chinese Han population. First, this proposed study will conduct deep resequencing functional regions of 12 newly identified novel sentinel loci to discover novel functional variants associated with hypertension among 300 hypertensive patients and 300 gender-matched healthy controls. Second, the proposed study will further verify the associations of novel functional variants with hypertension among 2,000 hypertensive patients and 2,000 healthy controls. Third, the study will use a series of bioinformatics tools to predict functions of identified variants, and examine key enzymatic biomarker regulated by gene variants. The proposed study will help to understand the molecular mechanisms underlying hypertension etiology, identify individuals at high risk for hypertension, and enable the discovery of new pharmaceutical prevention and treatment for hypertension in Chinese Han population.

2015年11月，国际著名学术期刊Nature Genetics发表了一项跨种族人群的大型高血压遗传学研究结果，该研究发现了在CPG岛附近有12个与血压相关的新位点（SNPs）。本研究将利用这12个新的标志性位点和先进的新一代测序技术，在中国汉族人群中，来进一步发现与高血压相关联的新的功能性遗传变异。首先，我们将选择300例高血压者和300例性别匹配的健康对照，针对这12个标签位点的相关功能区域进行深度测序，以发现新的与高血压相关的功能性遗传变异。其次，选择2000例高血压病例和2000例健康对照，进一步验证经测序所发现的遗传变异。最后，利用一系列生物信息学工具对新发现的相关遗传变异进行功能预测以及对基因所调控的关键分泌性蛋白酶指标进行血清学检测。本研究将有助于阐明高血压的遗传机制、预测高危个体以及发展新的高血压的防治药物。

2015年11月，国际著名学术期刊Nature Genetics发表了一项跨种族人群的大型高血压遗传学研究结果，该研究发现了在CpG岛附近有12个与血压相关的新位点,表明基因的DNA甲基化对血压可能具有重要的调控作用。本研究利用这12个新的标志性位点和甲基化测序技术,在中国汉族人群中，来探讨这些基因的目标区域的甲基化位点与高血压关系。首先，我们选择354个高血压病例和342个对照，针对这12个位点所对应的12个基因的目标区域，进行甲基化测序。其次，选择853个病例和927个对照，进一步验证经测序所发现的甲基化位点与高血压的关系。最后，利用甲基化、血压和体质指数（BMI）等数据，进行中介效应分析，以阐明甲基化、体质指数等因素在高血压发生中的相应作用。.研究发现，12个基因中的10个基因（包括AMH 、C17orf 82、HDAC9、 IGFBP3、LRRC10B、 PDE3A、PRDM6、SYT7 、TBX2 和 TTBK1）目标区域的相应甲基化位点及其水平与高血压合并缺血性脑卒中相关联。研究进一步表明，较高的甲基化水平与较低的高血压合并缺血性脑卒中危险性相关联。研究还发现，BMI对基因目标区域DNA甲基化位点与高血压之间的关系具有中介效应，中介效应占24.4%（P=0.058）; BMI对基因DNA甲基化位点与舒张压（DBP）水平之间的关系具有中介效应，中介效应占26.3%（P=0.048）。.本研究结果进一步验证了这12个基因中的绝大部分的基因的DNA甲基化影响高血压并对血压水平具有调节作用，进一步发现BMI对二者之间的关系发挥中介效应。这些结果具有重要的临床和公共卫生意义。这些有意义的基因DNA甲基化位点有可能作为新药的作用靶点，为改善高血压及其缺血性脑卒中的临床治疗提供新途径。另外，这些结果也提示，改变生活方式特别是控制体重对于预防高血压及其缺血性脑卒中的重要性。.