天蓝色链霉菌是模式菌之一。本项目拟采用PEI分级结合二维Blue Native/SDS PAGE与质谱的方法,鉴定天蓝色链霉菌的DNA结合蛋白复合物组。通过链霉菌模式菌株天蓝色链霉菌在多种不同培养基上生长发育的定性描述,首先为DNA结合蛋白的表达提供相应生理信息。通过Western方法全程跟踪,寻找最优化的PEI分级级份,有效地分离DNA结合蛋白复合物;用双向Blue Native/SDS PAGE,对PEI级份中的蛋白斑点进行质谱鉴定,分析确定蛋白复合物的分子量大小及蛋白间的相互作用。本研究将在对天蓝色链霉菌的DNA结合蛋白进行高通量鉴定的同时,定性描述这些蛋白表达时间与表达的生理条件,并提供明确的蛋白复合物分子量与蛋白质相互作用的信息。为理解链霉菌丰富多样的DNA结合蛋白在全局调控和局部调控过程中所起的各自功能积累数据;为理解链霉菌发育分化、抗生素产生的分子机制奠定基础。
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数据更新时间:2023-05-31
DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences
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