稻米糊化温度的功能性分子标记研究

糊化温度(GT)是稻米是淀粉理化特性和稻米品质的主要决定因素之一，阐明其遗传特性、寻找有功能的分子标记（functional marker）将为水稻品质改良提供可靠的分子技术。在前一个国家基金的资助下，测定了30个不同品质类型不同GT水稻品种的可溶性淀粉合成酶IIa基因的部分序列，共发现了24个单核苷酸多态性（SNP）和1个InDel，这些变异可以将30个品种划分为9个haplotype，并发现2个连续的SNP(GC/TT)与GT的相关性达到P<0.00001的显著水平。对509个品种的基因型鉴定表明有479个品种符合GC/TT规则，即只要是GC等位基因，就是高或中GT, 只要是TT等位基因，就是低GT。本项目将继续利用多条技术路线开展有功能的分子标记的开发，找到分别与高、中、低GT相对应的功能性分子标记，并利用遗传学方法进行验证，为利用功能明确的分子标记开展分子设计育种服务。