汉族人群重症抑郁症候选基因筛查、分子网络分析及其功能验证

基本信息
批准号:81571329
项目类别:面上项目
资助金额:57.00
负责人:王永刚
学科分类:
依托单位:上海交通大学
批准年份:2015
结题年份:2019
起止时间:2016-01-01 - 2019-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:张瑛,冯智英,毛英伟,俞羚,林岩,李文锦,邹静,李豪喆,丁文华
关键词:
重症抑郁症关联分析转基因动物候选基因基因多态性
结项摘要

Major depressive disorder (MDD) is one of the chronic recurrent mental disorder characterized by a pervasive and persistent low mood accompanied by low self-esteem and by a loss of interest or pleasure in normally enjoyable activities. MDD belongs to polygenic diseases. Lots of candidate genes associated with MDD have been proposed using genome-wide association study (GWAS), which plays a great role in the molecular genetic investigations of the mechanism of MDD. However, poor replication of these candidate genes was found by the previous reports and our previous studies. Thus, we are performing a comprehensive screening of candidate genes for MDD though literature and database search. The functional and pathway enrichment ananlyses were performed using String and DAVID, respectively. We attempt to identify the true genes and their SNPs which are associated with MDD, and identify the prognostic value of SNPs. Besides, transctiptional factors and miRNAs are predicted by Cistrome and miR SNPs finger software. The relationship between these predicted transctiptional factors and miRNAs and SNPs are investigated using Dual luciferase reporter system and electrophoretic mobility shift assay in T293 cells. Furthermore, the effects of functional SNPs on depressive-like behaviors and synaptic activity, as well as the possible underlying mechanisms, are ananlyzed in rats. Our findings would help to clarify the pathogenesis of MDD and provide the possible genetic susceptibility loci and drug tagets for early diagnosis and treatment of MDD.

重症抑郁障碍(MDD)是一种多基因遗传的复杂性精神疾病。多项全基因组关联分析提出了大量与MDD关联的候选基因,加深了人们对MDD分子遗传机制的认识。但文献及我们前期结果发现其分析结果的可重复性差且具有种族特异性;候选基因间的相互作用有待进一步研究。本课题组拟通过文献检索以及MK4MDD和 HuGE Navigator数据库检索的方式全面筛选与MDD相关联的候选基因;应用String和DAVID数据库对筛选出的候选基因做蛋白质互作网络和通路富集分析;以通路为单位,通过病例-对照研究和荟萃分析验证得出阳性SNPs;并分析其与临床指标间的相关性以及预后价值;在细胞水平初步分析阳性调控SNPs的作用机制;并利用转基因动物进一步开展功能性SNPs及其对应基因参与MDD的机制研究。本课题将进一步揭示MDD发病的分子机制,为寻求中国汉族人群MDD遗传易感位点及药物靶点提供理论依据和实验资料。

项目摘要

在课题资助下,在四年的研究中取得了以下进展:.1.随访102名药物过量性头痛患者(药物戒断后6个月),发现药物戒断前的两项因素可作为复发的重要预测指标:复发组的戒断前头痛频率高于无复发组,每次头痛服用2片以上止痛剂的患者复发风险更高。因此,戒断前头痛发作频率和止痛药剂量可作为MOH复发的独立预测因素。.2. 课题组对6102名中国女性进行数量性状研究。在FTO基因的12个SNP位点中,有9个与BMI指数显著相关。表明在中国女性中FTO基因的遗传变异与BMI指数存在很强的关联性,可以作为BMI相关药物研究的潜在作用靶点。.3. 课题组通过纳入符合月经相关性偏头痛患者100 例为病例组,匹配100 例非月经性偏头痛患者为对照组,发现与对照组相比,病例组维生素 D 水平较低,且维生素D 低于10 ng/mL 的患者是高于20 ng/mL 的患者发生月经相关性偏头痛的3.656 倍。表明低维生素D 水平可能与月经相关性偏头痛发生相关。.4.课题组对60名惊恐发作患者,以及60名健康对照进行关于维生素D水平的病例对照研究。发现惊恐发作患者维生素D水平明显偏低。随着维生素D水平逐渐升高,患病风险逐渐下降。.5.课题组对726名BPPV患者,以及502名健康对照进行基因靶向测序,筛查新的变异位点。在LOXL1基因上找到了10个变异位点,其中有一个位点rs1078967满足等位基因,基因型分布差异以及哈温平衡。该基因与脱落综合征相关,可能与耳石的脱落相联系。.6.以斑马鱼为模式生物,利用反义吗啉环寡聚核苷酸(MO)技术和激光共聚焦成像技术,发现内源性IFN-γ 在斑马鱼血管发育阶段具有促血管生成的作用。.7.通过体外细胞培养,利用免疫组化、荧光激光共聚焦成像、Western blot和细胞流式技术,发现生存素(survivin)可以抑制APP在细胞内的表达,同时survivin可以抑制APP过表达所引起的细胞凋亡。

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

玉米叶向值的全基因组关联分析

玉米叶向值的全基因组关联分析

DOI:
发表时间:
2

DeoR家族转录因子PsrB调控黏质沙雷氏菌合成灵菌红素

DeoR家族转录因子PsrB调控黏质沙雷氏菌合成灵菌红素

DOI:10.3969/j.issn.1673-1689.2021.10.004
发表时间:2021
3

正交异性钢桥面板纵肋-面板疲劳开裂的CFRP加固研究

正交异性钢桥面板纵肋-面板疲劳开裂的CFRP加固研究

DOI:10.19713/j.cnki.43-1423/u.t20201185
发表时间:2021
4

硬件木马:关键问题研究进展及新动向

硬件木马:关键问题研究进展及新动向

DOI:
发表时间:2018
5

基于SSVEP 直接脑控机器人方向和速度研究

基于SSVEP 直接脑控机器人方向和速度研究

DOI:10.16383/j.aas.2016.c150880
发表时间:2016

王永刚的其他基金

批准号:41776042
批准年份:2017
资助金额:74.00
项目类别:面上项目
批准号:31271140
批准年份:2012
资助金额:80.00
项目类别:面上项目
批准号:50274071
批准年份:2002
资助金额:24.00
项目类别:面上项目
批准号:11472142
批准年份:2014
资助金额:90.00
项目类别:面上项目
批准号:21373060
批准年份:2013
资助金额:83.00
项目类别:面上项目
批准号:31760028
批准年份:2017
资助金额:38.00
项目类别:地区科学基金项目
批准号:91849104
批准年份:2018
资助金额:50.00
项目类别:重大研究计划
批准号:11072119
批准年份:2010
资助金额:40.00
项目类别:面上项目
批准号:31770800
批准年份:2017
资助金额:55.00
项目类别:面上项目
批准号:U1261213
批准年份:2012
资助金额:240.00
项目类别:联合基金项目
批准号:30901895
批准年份:2009
资助金额:20.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:81400279
批准年份:2014
资助金额:23.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:31240001
批准年份:2012
资助金额:15.00
项目类别:专项基金项目
批准号:40606006
批准年份:2006
资助金额:25.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:61673281
批准年份:2016
资助金额:57.00
项目类别:面上项目
批准号:21203087
批准年份:2012
资助金额:25.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:21103025
批准年份:2011
资助金额:25.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:11272164
批准年份:2012
资助金额:82.00
项目类别:面上项目
批准号:21301063
批准年份:2013
资助金额:24.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:21076222
批准年份:2010
资助金额:35.00
项目类别:面上项目
批准号:10876014
批准年份:2008
资助金额:35.00
项目类别:联合基金项目

相似国自然基金

1

中国汉族人群重症药疹易感基因定位及其筛查芯片的制备

批准号:81171514
批准年份:2011
负责人:李颖
学科分类:H1204
资助金额:58.00
项目类别:面上项目
2

中国汉族人先天性孤立肾相关基因筛查

批准号:81170634
批准年份:2011
负责人:王朝晖
学科分类:H0501
资助金额:58.00
项目类别:面上项目
3

中国人MODYx家系MODY候选基因突变的筛查与功能解析

批准号:30771022
批准年份:2007
负责人:刘丽梅
学科分类:H0708
资助金额:30.00
项目类别:面上项目
4

中国汉族人群药物性皮炎相关基因的挖掘和功能验证

批准号:81071287
批准年份:2010
负责人:骆肖群
学科分类:H12
资助金额:36.00
项目类别:面上项目