致病性不同的草鱼呼肠孤病毒基因组序列及抗病毒基因分析

水生呼肠孤病毒(Aquareovirus)是基因组由多个RNA节段构成、感染鱼类的病毒病原。与其它分段基因组的病毒相同，具有易变异、重组率高、分布广、致病性高低不同的特点。这类病毒的代表种之一：草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus．GCRV)是我国最早报道的水产动物病毒，也称为草鱼出血病病毒(Grass carp haemorrhage virus, GCHV)。本项目拟在已分离到致病性不同的草鱼呼肠孤病毒株的基础上，分析比较其基因组序列和结构，获得鱼类呼肠孤病毒高、低(或无)致病株的基因组序列及基因组织结构信息；针对分节段双链RNA病毒基因组结构特征，利用基因工程技术和反向遗传技术，比较草鱼呼肠孤病毒基因重排与基因组合替换对宿主侵染性的影响；鉴定和筛选抗病毒候选基因；进而探讨水生呼肠孤病毒基因重组或组合替换所介导的抗病毒侵入机制，研发新的预防和控制草鱼出血病技术与方略。

水生呼肠孤病毒(Aquareovirus)基因组是含11个节段的双链RNA基因组。已从多种水生动物中分离到水生呼肠孤病毒，它们是鱼类一组重要的病毒病原。草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus．GCRV)是我国最早分离到的水产动物病毒，也称为草鱼出血病病毒(Grass carp haemorrhage virus, GCHV)。本项目在分离到不同鱼类呼肠孤病毒株的基础上，测定了两个鱼类呼肠孤病毒因组序列，鉴定了几个病毒基因的功能，并分析其致病性或与宿主的相互作用。获得鱼类呼肠孤病毒-109株(GCRV-109) 和SMReV 的全基因组序列，并与其它呼肠孤病毒进行比较。经对草鱼呼肠孤病毒GCReV-109 与其它呼肠孤病毒比较，阐明不同草鱼呼肠孤病毒基因组结构特征与其地域分布无显著关性；揭示草鱼呼肠孤病毒非结构蛋白NS80在招募病毒组分及形成水生呼肠孤病毒加工厂的过程中起至关重要的作用，并揭示NS80 与 NS38及其它病毒蛋白之间的相互作用。氨基酸序列比对及进化分析提示 SMReV是一个新的呼肠孤病毒组——水生呼肠孤病毒A (Aquareovirus A) 组成员。通经对 SMReV S7节段截短突变，发现一个使用非经典起始密码子编码的NS22蛋白是与细胞融合相关的小跨膜蛋白(FAST)。