利用全基因组关联研究的meta分析搜寻银屑病新的易感基因

本课题组前期利用收集到的一万余份寻常型银屑病样本完成了中国首个全基因组关联分析（genome-wide association analysis, GWAS）研究，并建立了7000多人份覆盖全基因组62万个SNP分型数据及相应的表型数据库。基于此，我们联合国外多个银屑病研究团队，获得数个独立人群的银屑病GWAS数据，利用meta分析和参照hapmap数据库采用插补（imputation）计算的方法，整合并对多个银屑病GWAS数据进一步分析，以期发现银屑病新的易感基因，为阐明银屑病的发病机制、风险预测和诊断治疗提供依据。同时对银屑病既往报道的易感区域在多个人种的数据间进行分析比较，以期发现银屑病发病机制的遗传异质性。本研究将为我国正在进行的重大疾病GWAS研究探索未来的研究方向。

利用全基因组关联研究的meta分析搜寻银屑病新的易感基因.银屑病具有显著的遗传异质性、表型复杂性及种族差异性的特征。以先前全基因组关联研究（GWAS）建立的中国人群银屑病SNP分型数据为基础，联合美国、德国、新加坡等7家单位，启动了目前世界上最大的银屑病全基因组关联研究的meta分析。以千人基因组计划数据库为参考序列，对汇集的8682份银屑病样本进行了全基因组数据填补（Imputation），并利用Plink分析软件分别对填补后的汉族人、高加索人全基因组数据进行关联分析，初步获取了150个可能的候选基因或位点。之后利用Sequenom和Taqman分型平台，先后在19449份高加索人群和15437份汉族人群银屑病病例与对照中，对获取的初筛基因进行验证，获得了3个银屑病新的易感基因（数据尚未发表），同时在已经鉴定的LCE、ERAP1、TNIP、IL28RA等42个银屑病易感基因／位点又发现新的易感信号。本研究结果表明，银屑病在不同种族人群之间存在着遗传异质性及发病率的差异，为今后深入进行银屑病分子遗传学的研究探明了方向。