拷贝数差异产生的ncRNA对神经母细胞瘤中DHRS4基因表达的调控

拷贝数差异(copy numer variation,CNV)在基因组差异和疾病相关基因等研究中的作用越来越受到人们的关注。CNV可以通过改变编码区、表达量及表达调控区而影响基因的表达。虽然CNV可以产生新的顺式、反式作用元件而影响基因表达，但这方面的例证并多见。我们发现辅酶II依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)的编码基因DHRS4是CNV基因，DHRS4基因在神经母细胞瘤细胞SH-EP和SH-SY5Y中存在与两种细胞表型差异相关的差异表达。这种差异表达可能是由于DHRS4拷贝数差异产生的具有反式调控作用的非编码RNA(ncRNA)引起。本项目拟通过RNA干扰、染色质免疫沉淀、RNA免疫沉淀、构建基因敲除细胞等方法证实上述设想，阐明ncRNA调控DHRS4基因表达的机制。研究结果对CNV生物学作用、ncRNA产生及作用方式的研究，以及对神经母细胞瘤视黄醇代谢调控的研究有重要参考意义。