中国鱚科鱼类分类与系统发育研究

The Sillaginidae, are ecologically important fish species which are widely distributed throughout the Indo-West Pacific region. The studies in phylogenetic classification of Sillaginidae have been carried out as early as 200 years ago, but the taxonomy and nomenclature were still controversial. In this study, Sillaginidae species and their corresponding geographic populations will be collected, and the systematics and taxonomy of Sillaginidae family will be re-estimated based on differentiations of morphology and multiply gene loci. The phylogenetic relationships will be re-constructed and the divergence time between species will be estimated by conjoint gene analysis. Furthermore, the genetic diversity and phylogeographic patterns of Sillaginidae species can be illuminated under this study. Our study will clarify the taxonomy of Sillaginidae, and contribute a lot to the rational exploitation and protection of Sillaginidae fish. It is also important to the development of marine fish geographic zoning, fish taxonomy and zoogeography.

鱚科鱼类种类多，分布广，在印度-西太平洋动物地理学以及近岸生态系统中都占有非常重要的地位。虽然鱚科系统学研究已有近200年历史，但分类和命名仍非常混乱，其科下阶元的划分存在争议和分歧。本项目以中国沿海鱚科鱼类为研究对象，采集所有物种分布区内的地理群体，通过形态学数据与多位点分子证据的结合，厘定我国鱚科鱼类分类，澄清目前物种分类的混乱；基于多基因联合分析，重建系统发育树，确定科下阶元及其系统发育关系，估算分歧时间；基于生物地理学原理与所构建的系统发育树，探讨鱚科鱼类多样性及其系统地理分布格局。本项目不仅可建立完善的鱚科鱼类分类系统、为我国乃至世界鱚科鱼类资源的开发利用与保护提供科学依据，对我国海洋鱼类地理区划以及鱼类系统学、动物地理学研究的发展也具有重要意义。

鱚科鱼类广泛分布于印度-西太平洋海域，由于外部形态十分相似，又缺乏有效的分类鉴别手段和系统整理，导致鱚科鱼类的分类和系统发育关系仍存在争议和混淆。本研究通过广泛采集国内外鱚科鱼类样品，采用线粒体和核基因等分子标记，结合可数可量性状、耳石、鱼鳔结构特征等形态学和比较解剖学信息，明晰了中国沿海鱚科鱼类种类组成、地理分布格局、系统发育关系及演化过程。主要研究结果：（1）对中国鱚科鱼类进行分类修订，并构建了鱚科鱼类31个分类单元的DNA条形码库，厘定中国沿海9种已命名的鱚科鱼类，报道了一个新种邵氏鱚，另有多个疑似新种待发布；（2）基于线粒体和核基因数据重构了鱚科鱼类系统发育关系，结果显示系统发育关系与鱼鳔复杂程度存在一定的相关性；（3）基于控制区序列的群体遗传学研究结果显示，多种鱚科鱼类群体间不存在遗传谱系结构，近期发生过群体扩张事件；（4）基于高通量测序技术组装了中国鱚全长转录组序列和染色体水平的基因组全序列，为后续鱚科鱼类比较基因组学研究奠定了基础；（5）基于转录组数据研究了中国沿海鱚科鱼类系统发育关系，结果与线粒体和核基因的分析结果相一致；（6）利用实验室已有少鳞鱚采样点信息，结合环境变量数据，构建了少鳞鱚物种栖息分布模型，预测未来气候变化情景下少鳞鱚分布区将呈现收缩和向极地移动的趋势。.本项目资助下，已发表论文12篇，其中SCI论文6篇；做国际会议报告3次，墙报发表9次；在国内会议上特邀大会报告发表1次，分组报告4次，墙报发表3次；培养博士生7名、硕士生2名、本科生1名。研究成果为鱼类生物多样性保护和资源开发利用提供了科学依据，同时促进了我国海洋鱼类地理区划以及鱼类系统学和动物地理学研究的发展。