5p15.33 TERT-CLPTM1L区域多态性与鼻咽癌的遗传关联研究

鼻咽癌是高发于我国南方的恶性肿瘤，具有颈淋巴结转移早、远处转移发生率高的临床特点，严重影响患者的治疗效果和预后。寻找能预测鼻咽癌发生风险与病程进展的有效指标一直是亟需解决的重要科学问题。近一年多来，多篇全基因组关联研究（GWAS）相继报道了5p15.33的TERT-CLPTM1L基因区域与多种肿瘤的发生风险相关。前人及申请人前期的免疫组化实验均发现，TERT和CLPTM1L在鼻咽癌组织中的表达均显著增高。通过生物信息学方法确定了TERT-CLPTM1L区域的26个单倍型标签SNPs。本项申请拟在此基础上，首先通过病例-对照和核心家系相结合的群体关联研究，确定这一基因组区域的多态性位点是否在群体水平与鼻咽癌的发生风险和病程进展具有相关性，然后采用一系列功能实验进一步明确显著关联的SNP位点的功能意义，揭示遗传学关联背后蕴含的生物学和医学意义，为未来的实际应用奠定基础。

TERT-CLPTM1L基因区域多态性已被报道与多种肿瘤的发生风险相关。该区域存在两个已知的基因，端粒酶反转录酶TERT和唇腭裂跨膜1样蛋白CLPTM1L基因。本研究探讨了这一基因区域多态性与鼻咽癌遗传易感性的关系。.本研究在TERT-CLPTM1L基因区域共确定了26个htSNPs。在广西鼻咽癌病例对照人群中分型成功25个位点，统计分析去除分布不符合哈迪-温伯格平衡准则的位点和最小等位频率（MAF）小于0.01的位点3个。以多因素logistic回归方法分析，在校正年龄、性别、吸烟、吸烟量、饮酒、家族史后，经过SNPSpD多重检验校正，在加性遗传模式和共显性遗传模式下共有4个SNPs（rs2736098、rs2735845、rs402710和rs401681）与鼻咽癌的发生风险相关。对这4个SNPs在广东鼻咽癌病例对照人群中进行了验证，发现rs2735845和rs401681仍然与鼻咽癌的发生风险显著相关（广西广东联合人群中rs2735845，OR = 1.23，P = 4.6E-5；rs401681，OR = 0.81，P = 1.0E-4）。在脐带来源的间充质干细胞中，与CC基因型相比，rs2735845 G等位携带者的CLPTM1L mRNA水平显著增加（P = 0.02）；与CC基因型相比，rs401681 TT基因型与短的端粒长度显著相关（P = 0.002）。免疫组化实验显示，TERT、CLPTM1L在鼻咽癌组织中表达均高于非癌鼻咽部组织。.TERT功能性串联重复MNS16A的S等位型是鼻咽癌发生风险的保护等位型（OR = 0.86，P = 0.014），且在分化差的鳞状细胞癌组中其保护作用更显著。携带S等位的鼻咽癌患者年龄较LL基因型鼻咽癌患者年龄大。免疫组化实验显示S等位型的TERT蛋白的表达显著低于LL基因型（P = 0.035）。.本研究首次鉴定出了与鼻咽癌遗传易感性关联的TERT-CLPTM1L基因区域中的两个SNP位点（rs2735845和rs401681）和一个串联重复多态性位点（MSN16A）。本研究为鼻咽癌的遗传易感性提供了新的遗传标记，有助于鼻咽癌发病机理的进一步研究和鼻咽癌的早期预防、诊断和个体化治疗。