脱氧核糖核酸(DNA)的光物理和光化学过程理论模拟

基本信息
批准号:20973025
项目类别:面上项目
资助金额:34.00
负责人:陈雪波
学科分类:
依托单位:北京师范大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:丁丽娜,方遒,韩娟,潘阳,江洁玲
关键词:
DNA光物理基于半经验的QM/MM动力学理论光生物光化学CASPT2//CASSCF/Amber
结项摘要

本项目发展、应用半经验和从头算(CASSCF//CASPT2)方法并与分子力学(QM/MM)及动力学方法相结合(QM/MM MD),以复杂环境中的DNA碱基、寡聚和多聚核苷为对象,探索DNA光物理、光化学过程所涉及的一系列复杂问题。本项目通过计算光化学、光物理途径(势能面)、激发态经典轨迹和基态动力学模拟,并结合时间分辨的飞秒激光技术,研究(1)复杂环境中的DNA碱基的超快光物理(光循环)过程;(2)确定寡聚核苷的激发态本质,探索其光物理(光循环)机制;(3)多聚核苷中TT、CC和CT等二聚体的形成机制及其前驱态的本质;(4)光诱导DNA双链解离机理、时间分辨的能量传递机制和反折叠的氢键动力学。本项目的研究将为理解DNA的损伤和修复过程提供理论基础。

项目摘要

本项目发展、应用半经验和从头算(CASSCF//CASPT2)方法并与分子力学(QM/MM)及动力学方法相结合(QM/MM MD),以复杂环境中的DNA 碱基、寡聚和多聚核苷为对象,探索DNA 光物理、光化学过程所涉及的一系列复杂问题。本项目通过计算光化学、光物理途径(势能面)、激发态经典轨迹和基态动力学模拟,并结合时间分辨的飞秒激光技术,研究(1)复杂环境中的DNA 碱基的超快光物理(光循环)过程;(2)确定寡聚核苷的激发态本质,探索其光物理(光循环)机制;(3)多聚核苷中TT、CC 和CT等二聚体的形成机制及其前驱态的本质;(4)光诱导DNA 双链解离机理、时间分辨的能量传递机制和反折叠的氢键动力学。本项目的研究将为理解DNA 的损伤和修复过程提供理论基础。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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