靶向外显子组测序高效实用检测眼遗传病基因突变的研究

眼遗传病是儿童双眼盲的主要原因，多难治或不可治，基于基因突变检测的优生诊断是目前最有效的防治措施。然而，尽管已确定大量眼遗传病致病基因，但由于眼遗传病的高度遗传异质性和临床多样性，致病基因众多且多缺乏突变热点，目前的技术方法难以有效检出大多数眼遗传病的致病突变，突变检测耗时漫长且涉及费用巨大，大多数眼遗传病优生诊断无法广泛开展。本项目结合已有基础和优势，参照最新全外显子组测序技术原理，设计靶向外显子组捕获系统，定向捕获全部眼遗传病227个基因的外显子，然后用新一代测序技术检测这些基因的全部外显子及其紧邻的内含子区域。通过对已知突变样本和未知突变样本的两批测试，建立快速高效、简便可靠、经济实用的眼遗传病基因突变检测与优生诊断新方法，使大多数眼遗传病优生诊断成为可能。结果对防盲和优生有重要意义。

眼遗传病是儿童双眼盲的主要原因，多难治或不可治，基于基因突变检测的基因诊断是预防与干预的基础。然而，尽管已确定大量眼遗传病致病基因，但由于眼遗传病的高度遗传异质性和临床多样性，致病基因众多且多缺乏突变热点，目前的技术方法难以有效检出大多数眼遗传病的致病突变，突变检测耗时漫长且涉及费用巨大，大多数眼遗传病基因诊断无法广泛开展。本项目结合已有基础和优势，比较分析传统测序与全外显子组测序在不同眼遗传病中突变检测的情况，设计覆盖不同范围眼遗传病致病基因的靶向外显子组捕获系统，定向捕获常见眼遗传病基因（403个）、眼前段眼病相关基因（361个）、眼后段眼病相关基因（386个），通过在Miseq平台上的测序分析，比较不同来源探针、不同测序深度、不同读长、不同类型突变的检出情况，并与分析传统测序、全外显子组测序结果比较，得到了有可能在临床广泛应用的快速、可靠、经济的基于靶向外显子组捕获与测序体系。结果可以大大简化眼遗传病基因突变检测与基因诊断，使大多数眼遗传病常规临床基因诊断成为可能。结果已发表国际期刊论文11篇。本项目研究达到了预期目标。