一种深海适冷菌分泌的新型蛋白酶deseasin MCP-01的催化机制

假交替单胞菌SM9913是一株分离自深海沉积物的适冷菌。该菌株分泌的蛋白酶MCP-01 是一种新型的多结构域的subtilase，我们将其命名为deseasin（Chen et al,Microbioly-SGM,2007）。MCP-01的成熟酶除N端的催化结构域以外，C端还有一个PKD结构域。MCP-01和其它蛋白酶明显不同的结构预示着它可能具有不同的催化机制。本项目首先研究酶的底物结合部位特征和其特异性切割位点及对各位点的催化效率, 阐明其对可溶性蛋白的催化机制；然后研究酶C-端的PKD结构域和其突变体对颗粒状蛋白底物的结合能力以及MCP-01和其PKD结构域缺失突变体对可溶和不可溶蛋白的催化效率，阐明PKD结构域在酶催化过程中的功能和该酶催化降解不可溶蛋白底物的分子机制。这些研究将为开发新型蛋白酶MCP-01的新用途和揭示深海沉积物中蛋白质的分解代谢与氮循环机制提供理论依据。