沙门氏菌严格宿主适应性的进化

基本信息
批准号:30970119
项目类别:面上项目
资助金额:35.00
负责人:刘树林
学科分类:
依托单位:哈尔滨医科大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:李飞峰,徐晖,李庆海,霍霄,王磊,刘佶,王春晓,徐华锋,刘栋楠
关键词:
基因组进化基因置换宿主适应性伤寒沙门氏菌基因退化
结项摘要

病原菌的宿主适应性是个很重要的生物学现象,关系到新病原体的出现、病原体致病特性的改变、宿主与病原体之间相互作用机制等领域的研究,与人类健康事业密切相关。然而,迄今人类对此了解非常有限。本项目以沙门氏菌为模型,探讨细菌宿主适应性进化的遗传学基础和分子机制。绝大多数的沙门氏菌可感染多种宿主,而伤寒沙门氏菌等少数血清型只感染人,鸡白痢沙门氏菌只感染禽类,等等。我们将通过全基因组序列分析比较广泛宿主和单一宿主沙门氏菌,鉴定出其间的基因组差异。我们设想,沙门氏菌的严格宿主适应性来源于2方面的遗传因素,包括主动(基因横向转移和突变)和被动(基因删除和退化)基因组进化事件。我们将对鉴定出的候选基因进行生物信息学预测,按其理论上的重要性排序,把候选基因在目标菌株上通过基因置换法敲入或敲除,进行动物实验,验证其在宿主适应性上发挥的作用。

项目摘要

病原菌的宿主适应性是个很重要的生物学现象,关系到新病原体的出现、病原体致病特性的改变、宿主与病原体之间相互作用机制等领域的研究,与人类健康事业密切相关。然而,迄今人类对此了解非常有限。绝大多数的沙门氏菌可感染多种宿主,而伤寒沙门氏菌等少数血清型只感染人,鸡白痢沙门氏菌只感染禽类,等等。我们设想,沙门氏菌的严格宿主适应性来源于2 方面的遗传因素,包括主动(基因横向转移和突变)和被动(基因删除和退化)基因组进化事件。本项目我们以沙门氏菌为模型,探讨了细菌宿主适应性进化的遗传学基础和分子机制。我们通过全基因组序列分析比较广泛宿主和单一宿主沙门氏菌,鉴定出其间的基因组差异,并对鉴定出的候选基因进行生物信息学预测,按其理论上的重要性排序,把候选基因在目标菌株上通过基因置换法敲入或敲除,最后进行动物实验,验证其在宿主适应性上发挥的作用。本课题组在分析鉴定出Salmonella paratyphi C基因组152个假基因的基础上,在S. pullorum基因组上鉴定出200多个假基因,为下一步与S. typhi, S. paratyphi A, S. gallinarum等沙门菌的基因组比较研究打下了良好基础。已经初步确定动物实验的候选基因,目前处于菌株构建阶段。与此同时,我们对代表性沙门菌的一系列致病因子进行了深入研究,从功能的角度为沙门菌宿主适应性分子机制的阐明做了重要的积累。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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