大分子系统的广义朗之万动力学模拟方法

本工作主要是用广义郎之万动力学的理论，建立正确的溶剂模型和广义郎之万动力学模拟程序库。在国际上首先将蛙跳算法用于广义朗之万动力学的数值积分，并用新建立的程序库对环孢霉素进行了广义朗之万动力学模拟。并用连续介质模型的边界元法与广义朗之万动力学相结合，完成对环孢霉素的模拟。将模拟结果与分子动力学、随机动力学模拟结果比较，发现该方法较之分子动力学、随机动力学模拟方法有明显的改进，表明该方法对大分子体系是可靠的。在完成任务书研究计划的基础上，已超额完成本项基金计划。本工作对研究生物大分子体系的溶剂效应及其对体系结构和动力学性质的影响具有重要的科学意义和应用前景。