沙门氏菌分子检测特异性靶点的发掘与评价

采用公共数据库中沙门氏菌（Salmonella）和其它微生物的基因组序列信息以及本课题组获得的序列信息，利用以并行计算为核心的数据发掘平台，通过序列比对分析，发掘出了200个左右沙门氏菌基因组特异性片段。构建可视化微生物基因组自动注释与分析系统，借助此系统，在这些特异性片段中筛选出与沙门氏菌致病性相关的基因和调控元件，将上述特异性片段数缩小至50个左右，并针对这些候选检测靶点，分别设计特异性引物，建立沙门氏菌PCR检测方法。在此基础上，同时与目前常用的检测靶点进行对比分析，对候选靶点的特异性、灵敏度、抗干扰性和重复性进行评价，期望筛选出10个左右具有我国自主知识产权的沙门氏菌特异性检测靶点，为沙门氏菌分子检测和鉴定提供靶点资源，并为其它食源性致病菌分子检测靶点的筛选提供新思路。