遗传性包涵体肌病候选基因筛查及新致病基因定位研究

The hereditary inclusion body myopathies (h-IBM) are a heterogeneous group of autosomal-dominant (AD) or autosomal-recessive (AR) adult-onset muscle disorders with variable clinical phenotypes and special myopathological presentation, including rimmed vacuoles (RV) and intracytoplasmic and intranuclear tubulo?lamentous inclusions. Studies on Chinese h-IBM patients started relatively late. Most patients have been misdiagnosed or missed diagnosis, and the hereditary characteristics of Chinese h-IBM patients were not clear. This study based on the genetic resources of Chinese h-IBM patients and families. We will perform mutation screenings of GNE, MHY3 and VCP genes by using polymerase chain reaction (PCR) and sequencing. All mutations will be further confirmed by single nucleotide polymorphism (SNP) analysis using the SnaPshotTM Multiplex System Kit. We plan to find the novel causative gene of Chinese h-IBM family by using microsatellite markers and linkage analysis or exome sequencing .The objectives of our study are: 1) build Chinese h-IBM genetic resource and DNA database.2) identify novel mutations of candidate gene of h-IBM in Chinese patients.3) identify causative gene for Chinese h-IBM family with uncertained classification. The results of this study will further expand the clinical and genetic spectrum of h-IBM in China, and provide useful clues as to the genetic causes of h-IBM.

遗传性包涵体肌病(h-IBM)是一组具有多种临床表型和特殊肌肉病理表现（镶边空泡及肌内包涵体）的遗传性骨骼肌疾病。我国h-IBM研究起步晚、临床误诊和漏诊率高、遗传特点不明确。本课题旨在立足中国h-IBM患者及家系遗传资源，采集h-IBM患者及家系DNA样本，通过采用PCR扩增、测序、比对方法对h-IBM患者进行GNE、MHY3、VCP等已知候选基因筛查，采用SNaPshot对候选基因新发突变进行验证；通过微卫星标记全基因组扫描的连锁分析或全外显子测序技术，对不明确分型h-IBM家系进行基因定位研究。以期通过本课题建立中国h-IBM患者遗传资源信息数据库和DNA样本库；了解目前已知致病基因对中国h-IBM家系的分布，检测已知基因在中国患者中存在的新突变位点和突变型，进一步扩展中国人群h-IBM已知致病基因突变谱；完成不明确分型h-IBM家系致病基因定位，为进一步的基因克隆研究奠定基础。

背景：遗传性包涵体肌病（h-IBM）是一组临床和遗传异质性的疾病，以病理出现镶边空泡为特征。由于其临床表现多样、致病基因不一，临床诊断较为困难，部分未知表型的h-IBM存在，使致病基因检测对该类疾病的诊断尤为重要。.主要研究内容：本研究通过二代基因芯片及PCR测序技术对h-IBM进行已知致病基因筛查、鉴定，对不明确分型的h-IBM家系，通过全外显子测序进行致病基因定位研究。.重要结果及关键数据：本研究纳入患者共31例，包括16例致病基因明确的h-IBM患者和15例未明分型的h-IBM家系患者。致病基因明确的h-IBM患者包括6例GNE肌病，4例OPDM，2例MFM，2例RBM，1例XMPMA，1例LGMD1E。其中，GNE肌病有6种GNE基因突变，包括已知突变：c.736G>A（p.R246Q），c.1892C>T（A631V），c.527A>T（p.D176V），及未知突变：c.556T>C（p.Y181H），c.1711_1712del（p.571_571del），c.1634-1G>C（splicing）；OPDM排除了PABPN1第1号外显子（GCN）n拷贝数异常；MFM有1个DES基因已知突变：c.1109T>C（L370P）和1个LDB3基因新发突变：c.480G>C（p.M160I）；RBM为FHL1基因已知突变：c.448T>C（p.C160R）；XMPMA有2个FHL1基因新发突变：c.787G>A（p.D263N）和c.814T>C（p.S272P）；LGMD1E为1个DNAJB6基因新发突变: c.279C>G（p.F93L）。发现2个未知分型的h-IBM家系，家系1呈常染色体显性遗传，全外显子测序分析提示ANKRD32 和C19orf26为可能的致病基因；家系2呈常染色体显性或常染色体隐性遗传，全外显子测序分析提示THAP7 和PABPC1可能为致病基因。.科学意义：发现3个GNE基因新发突变，1个LDB3基因新发突变，2个FHL1基因新发突变和1个DNAJB6基因新发突变。发现中国第1个RBM家系，第1例LDB3基因突变所致MFM患者，第1例XMPMA患者和第1例LGMD1E患者。发现1个h-IBM家系的致病基因可能为ANKRD32 和C19orf26；另一个h-IBM家系的致病基因可能为THAP7 和PABPC1。