血管内皮生长因子基因多态性在海南黎族和汉族慢性阻塞性肺疾病患者中的对比研究

本课题采用病例对照研究策略、以Taqman SNP genotyping等方法，分析海南黎族和汉族种族间、种族内患病的危险因素并进行对比；检测COPD患者VEGF基因中遴选出的标签单核苷酸多态性（tag SNP）和及以此为基础基因单倍体在COPD的发生和发展的遗传易感性。分析种族内、种族间COPD患病的影响因素及遗传易感性的差异，环境等因素与COPD基因多态性的交互作用，试图从种族、环境和基因多态性变化的多角度多层次探索COPD的发病机制。不仅可为海南黎族COPD的防治提供较为全面的流行病学及遗传资料，成为政府制定卫生政策的依据，并期望能发现新的突变或缺失类型。通过对易感性位点进行生物学功能的深入探讨，为该病的基因型到表型的VEGF功能基因组学提供有价值的材料，而且将首次揭示海南黎、汉族COPD患者遗传和基因多态性变化的类型及其生物学功能，对丰富我国生物资源基因库的内涵具有重要的科学意义。

本课题对海南黎族汉族慢性阻塞性肺疾病（COPD）患病率调查及危险因素进行了对比分析，对血管内皮细胞生长因子A(VEGFA)等基因单核苷酸多态性（SNP）及蛋白水平进行了对比研究，结果显示：（1）海南局部地区黎族40岁以上COPD的发病率为5.07%、低于但接近国内8.2%的平均水平；其男女患病比例为1：1，与国内其他地区男女患病比例2.4：1有明显差异；海南黎族COPD发病与年龄、体重指数、生物燃料烟雾、吸烟、反复的呼吸道感染密切相关；海南地区黎、汉族COPD危险因素既有区别又存在共同点：对于黎族人群，低体重也就是说营养不良是一个明确的危险因素，生物燃料烟雾也是重要因素，提示改善营养状况及居住环境对预防黎族COPD有重要意义；（2）基因多态性与COPD的发病风险研究显示VEGF基因的九个SNPs位点中两个位点的多态性在海南汉族人群中存在显著性差异，而黎族人群中未发现与COPD的发病风险相关。四个位点在黎族和汉族人群等位基因频率分布存在较大差异，证实海南黎族和汉族不同民族中各位点基因频率和表现型有种族和地域的差别。提示海南汉族人群中VEGF基因在COPD的发生中起着更重要作用。进一步对环指蛋白（RNF150），跨膜蛋白（TMEM173），亚铁结合氧化还原酶（EGLN2），低氧诱导因子1（HIF1）和猪铁效应元件结合蛋白2（IREB2）等22个基因的33个SNPs的研究，发现CHRNA5、SETD7、ATP2C2，FAM13A、IREB2基因上的5个SNPs与黎族人群的COPD发病风险相关。RNF150，TMEM173，ZBTB9，EGLN有4个位点与汉族COPD的发病风险相关。（3）蛋白水平的研究发现汉族COPD病例组的VEGFA、HIF-1α水平明显高于对照组，而在黎族COPD病例组的VEGFA、VEGFD水平明显高于对照组，黎族COPD的VEFGA、HIF-1α水平均明显低于汉族人群。.我们的研究首次初步揭示了海南黎族COPD患病率、危险因素、VEGFA等基因多态性及蛋白表达水平的特点，并发现其与汉族COPD的存在一定差异，提示不同民族COPD的影响因素及发生机制可能有所不同，揭示了海南黎族汉族COPD患者遗传和基因多态性变化的类型，丰富了我国生物资源基因库。更为重要的是为海南少数民族黎族COPD的防治提供了科学的数据及依据。