人源Apelin受体的晶体结构研究与药物设计

基本信息
批准号:31670736
项目类别:面上项目
资助金额:60.00
负责人:徐菲
学科分类:
依托单位:上海科技大学
批准年份:2016
结题年份:2020
起止时间:2017-01-01 - 2020-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:岳洋,张贤君,梁蓝
关键词:
配体结合口袋药物设计晶体结构膜蛋白Apelin受体
结项摘要

G-protein coupled receptors (GPCRs) constitute the largest membrane protein family in the human genome. With over 800 family members identified so far, these receptors mediate over 80% cell signaling, ranging from photons, smells, tastes, hormones, neuropeptides, proteins, and so on. Distributed almost everywhere in the human body, GPCRs are associated with a variety of physiological and pathological processes. Dysregulation of GPCRs could lead to numerous human diseases, including cancer, immune diseases, diabetes, neurodegeneration, cardiovascular disorder, and so on. The molecular recognition of ligand in the receptor—the ligand binding mode is considered the major target for drug design. Hence, structural determination of the ligand binding pocket and the receptor conformation upon ligand binding is the key to understand the molecular mechanism for GPCRs and to guide new-generation rational drug discovery. Here, we propose to discover the structure-function relationship of the apelin receptor, an important target for cardiovascular diseases and key modulator in heart failure, by employing state-of-the-art membrane protein crystallography and other biochemical and biophysical techniques. The goal is to determine a series of first-in-class apelin receptor structures in complex with different ligand, including small molecule ligands as well as peptide ligands. These structures, together with functional characterizations, will draw a ligand binding landscape for apelin receptor and guide for structure-based drug discovery.

G蛋白偶联受体,简称GPCR,在人体基因组中有800多种,负责介导超过80%的细胞信号转导。其结构或功能异常可导致重要的人类疾病,如癌症、糖尿病、神经退行性疾病、心血管疾病。受体与胞外信号分子,即配体的相互识别以及配体-受体相互作用引起的构象变化被认为是药物设计的靶点。因此,使用结构生物学手段解释配体结合受体的结构基础及相互作用机制对于开发特异性药物具有重要的意义。该项目中,申请人课题组将对GPCR家族中的人源Apelin受体展开系统的结构与功能研究,通过探索一系列配体结合受体的复合物结构,进一步了解Apelin受体与配体相互作用的机制,并基于结构设计新的配体,开发药物。目前,课题进展顺利,已成功获得Apelin受体与一个配体的高分辨率晶体。由于Apelin受体是重要的心血管疾病尤其是心脏衰竭的药物靶点,并作为HIV病毒浸染人体的共受体,针对其展开的特异性药物分子设计将具有广阔的应用前景。

项目摘要

Apelin受体(APJ)是GPCR A家族中的一员,是新型的重要的心血管疾病靶标。已知目前死于心血管疾病的患者仍居世界第一,因此,该受体的结构研究对于后续针对心血管疾病的药物筛选具有重要的意义。本项目中,我们通过X射线晶体学的方式解析了APJ受体与内源性配体apelin类似物的第一个晶体结构(Ma Y, Yue Y, et al, Structure,2017)。该结构揭示了APJ与多肽配体的“双位点”识别机制,对于理解APJ配体识别及信号传导的结构机制有开创性的推动作用。然而,APJ的药物设计主要集中于小分子配体,且理解受体的激活机制对于精准药物开发具有重要的指导意义。因此,我们继续开展了一系列小分子化合物的共结晶实验,并获得了与APJ的复合物结构。另一方面,我们积极探索冷冻电镜在解析APJ激活复合物结构中的可能性,并首次获得了APJ结合激动剂配体以及下游G蛋白三聚体的激活态复合物结构。这一系列成果都将为APJ受体激活机制的理解以及药物开发提供独到的见解,具有广阔的生物学意义和应用前景。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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