宁夏回族人群非综合症唇腭裂候选基因和位点的关联性研究

本研究根据目前最新的三个NSCL/P的GWAS研究结果，选择了其中最有意义的IRF6,MAFB两个基因和8q24.21区段作为候选基因和区段，研究在宁夏回族人群中与NSCL/P的相关性。拟收集300个 NSCL/P三人核心家系及300名对照组。首先选择小样本进行个性化目标候选基因和区域捕获测序，针对性筛查、发现新的和验证候选的遗传变异SNPs, CNVs位点和区域。再在大样本中对上一步精选验证的SNP和CNV检测验证。应用病例－对照和传递不平衡（TDT）方法进行关联研究。通过分析父母 - 子女对（Trios ）样本，比较子女与父母的SNPs差异，来发现子女与父母传递CNVs的差异。应用实时荧光定量PCR和多重连接探针扩扩增法(MLPA)以及FISH的方法验证不符合孟德尔传递规律的新的CNVs的准确性。探讨宁夏回族人群中遗传变异与NSCL/P的关联性。

非综合征型唇腭裂（NSCL/P）是人类最常见的先天性出生缺陷疾病之一。本课题收集了来源于宁夏医科大学总医院就诊的652例NSCL/P患者以及 宁夏医科大学433 例大学生正常对照组，同时增加了31个大家系（家系中至少2个或2个以上NSCL/P患者）样本的收集。采取TaqMan 基因型鉴定技术、聚合酶链反应 - 限制性片段长度多态性 （PCR-RFLP ） 、全基因组关联分析研究（GWAS）、全外显子捕获测序技术和临床研究，应用传递不平衡检验(TDT)、病例对照分析和以家系为基础的相关性分析等统计方法，不仅研究了IRF6、MAFB两个基因和10q25.3 区段的SNPs 位点与非综合征型唇裂伴或不伴腭裂（NSCL/P）相关性，根据国内外发展前沿及进展，扩展研究范围进一步发现，在中国西部人群中IRF6（rs1044516、rs742214、rs2235371、rs596731、rs10867390 ）、ABCA4 （rs560426）、 MAFB（rs13041247、rs6072081、rs6065259、rs17820943、rs11696257）3个基因SNPs位点及17q22（rs227731）、10q25.3（rs7078160）、 17p13.1（rs4791774）、 20q12（rs13041247）4个染色体区段SNPs位点与 NSCL/P 的发病存在相关性；并首次在中国西部人群新发现16p13.3区域rs8049367与 NSCL/P 的发病存在相关性。同时进行临床研究发现，唇腭裂患儿父母生活质量及社会支持情况偏低，心身健康状况较差，早期心理干预对唇腭裂患儿家长具有重大影响，而且对患儿的心身健康也具有积极的意义。单侧完全性唇裂鼻畸形患儿整形术后应用鼻膜可改善鼻畸形，有一定临床效果。我们还需要更进一步验证这些基因突变与非综合征型唇腭裂的相关性，如在未来能够基于此次研究成果制备个性化的易感检测基因芯片并在育龄和高危人群中推广使用，可以有效实现预防为主的婚前检查、孕期筛查及产前检测的“三级”预防策略，降低唇腭裂的发生率。