恙虫病东方体基因变异株病原与分子流行病学研究

A novel genotype of Orientia tsutsugamushi (Ot), which was different from the known prototypical and reference strains, was detected and denominated as STA-07. The pathogenic and epidemiological characteristics of STA-07 strain remain unclear. The present study is to identify the pathogenic characteristics of STA-07 and other possibly existing genetic variants of Ot, and clarify the features of their infection and epidemicity, with techniques and methods of epidemiology, etiology and molecular biology. The research contents include: ①The characteristics of coding sequences and protein structure of 56kDa type-specific antigen (TSA) of the genetic variants; ②The pathogenic characteristics of the genetic variants, and the association with their molecular structures of TSA; ③The distribution of the genetic variants in animal hosts and vector mites; ④The clinical and epidemiological features of scrub typhus caused by the genetic variants. The results of the study will enrich the theory of etiology and epidemiology of the disease, and provide important scientific data for its prevention and control in China.

近年来我们研究发现，在山东省恙虫病新流行区存在一组有别于已知国际参考株的恙虫病东方体（Orientia tsutsugamushi, Ot）基因变异株STA-07。目前，该新型Ot变异株的病原学及流行病学特征尚不清楚。本研究的目的在于应用流行病学、病原学与分子生物学的技术和方法，研究STA-07及其他可能存在的Ot基因变异株的病原学及其感染与流行的特征和规律。研究内容包括：①Ot基因变异株56kDa型特异性抗原（type-specific antigen, TSA）编码基因序列、蛋白结构及其特点；②Ot基因变异株的病原学特征，及其与TSA分子结构的关系；③Ot基因变异株宿主及媒介分布；④Ot基因变异株人群感染的临床及流行病学特点。预期结果可补充恙虫病的病原学及流行病学理论，对我国该病的预防控制具有重要意义。

近二十余年来，恙虫病疫区在我国北方地区不断蔓延，流行强度呈上升趋势。恙虫病东方体(Orientia tsutsugamushi，Ot)变异活跃，抗原型别分布有明显地域差异，对一个国家或地区的Ot变异株及优势株进行深入研究，是该病诊断及预防控制的基础。.该研究以流行病学、病原学及分子生物学技术方法，对山东地区Ot变异株Sta-07及优势Ot流行株自宿主、媒介、病人进行流行病学调查。分析了Sta-07及类Kawasaki Ot 56 kDa型特异性抗原(type-specific antigen, TSA)的基因结构，及其与主要国际参考株核苷酸、编码氨基酸序列的差异与同源性关系。对Sta-07 Ot 56 kDa TSA 的基因编码产物进行了预测分析，包括二级结构预测、跨膜区预测、信号肽预测与抗原表位预测。分析了类Kawasaki Ot感染所致患者的临床特征。分析了Ot感染患者的血清型及其与Ot基因型的关系。研究结果初步表明了该Ot变异株及优势流行株的流行状况，表明了其56kDa TSA的分子结构与进化特征、感染血清学特征，表明了Ot优势流行株的临床特征与重症患者的影响因素。.该研究结果补充了Ot分子生物学与恙虫病的流行病学数据，对该病的预防控制及临床诊治提供了重要的科学依据。