广西HIV感染长期不进展与病毒基因突变及修饰的相关性研究

The group of HIV positive long term non-progressors（LTNPs）comprises 2-9 percent of the total HIV population. These individuals have become the center of many studies to identify mechanisms of spontaneous viral control. CRF01_AE subtype was associated with fast progression to AIDS. CRF01_AE, along with CRF08_BC, is the dominant strain in Guangxi province. However,there are 90 cases survival LTNPs in Guangxi. Several factors may take part in the control of HIV disease progression,including defective viral strains and epigenetic modifications. Previous relatively studies have associated gene mutation and epigenetic modification of provirus with disease progression, but there are controversial conclusions. We will detect the viral gene mutation and DNA methylation patterns in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from LTNPs, compared with patients in whom HAART resulted in the suppression of plasma viremia。we will also identify the subtypes, detect the viral load and levels of CD4. We will analyse more rigorously whether particular proviral mutation and epigenetic modification are associated with HIV disease progression. This study will be possible to provide experimental basis and have important implications for strategies aimed at vaccine research and antiretroviral therapy.

HIV感染长期不进展者约占HIV感染总人群的2-9%。这些长期不进展者已经成为HIV 自发病毒控制研究领域的研究热点。CRF01_AE 亚型与HIV快速进展有关, 我们广西流行的亚型以CRF01_AE和CRF08_BC为主, 然而在广西有90例存活的长期不进展者。影响HIV感染进程的因素是多方面的，其中可能涉及到病毒缺陷和表观修饰等因素。曾经有少量的相关研究表明HIV的基因突变和基因修饰与疾病发展的进程有关系，但是还存在很多争议。我们将比较分析广西长期不进展者和对照组病人外周血单核细胞中病毒的突变及DNA甲基化情况，进行病毒分型，分析它们与病毒载量、CD4水平的相关性，探讨病毒突变及表观修饰对HIV感染疾病进程的影响。本次研究有可能为HIV疫苗研究以及抗病毒治疗策略提供一定的实验依据。

项目的背景 .HIV感染长期不进展(LTNP)与宿主免疫和遗传及病毒2个主要因素有关，目前针对CRF01_AE亚型的研究还比较少，病毒基因突变和基因修饰对LTNP的影响也存在着很多争议。.主要研究内容 .项目以广西HIV长期不进展者为观察组，分析不同疾病进展组其HIV前病毒（Provirus）LTR、Env、Nef、Vpr、Rev的基因突变位点和甲基化修饰的情况，分析其宿主CCR5多态性和HLA-B等位基因的情况，了解它们与病毒载量、CD4+T细胞水平的相关性，探讨它们对HIV感染疾病进程的影响。.重要结果及数据 .共有202例研究对象入组分析，其中，ART 64例，LTNP39例,NC 44例,RP 22例,TP 37例。获得111例HIV感染者pol区基因序列，发现5种基因亚型，分别为32例（28.8%）CRF01_AE，、16例（14.4%）CRF07_BC，58例（52.3%）CRF08_BC，3例（2.7%）C和2列（1.8%）URF。其中，LTNP以CRF08_BC（54.5%）为主，其次为CRF07_BC（24.2%）和CRF01_AE（18.2%），而RP以CRF01_AE（72.2%）为主。不同疾病进程HIV感染者,其宿主CCR5基因均未见有明显的SNP突变发生，也未发现有CCR5-∆32、CCR5-894C缺失。B*46:01:01在LTNP、TP、RP中出现频率分别为9.52%、13.33%和25.58%，与中国红十会数据库中出现的频率（10.22%）比较，RP中出现频率最高，其次是TP中出现频率，而LTNP略低些。B*38:02:01在LTNP、TP、RP中出现频率分别为5.95%、7.78%和11.29%，均高于中国红十会数据库中出现的频率（2.61%）。.科学意义 .HIV感染长期不进展者以CRF08_BC毒株为主，而快速进展者以CRF01_AE为主，提示 CRF01_AE的HIV感染者其疾病进展比CRF08_BC的快。B*46:01:01和B*38:02:01二个等位基因出现的频率可以作为预测HIV感染者的疾病进程的指标。这些重要发现对进一步研究HIV感染者疾病进程的影响因素、机理等等方面提供实验依据。