全基因组关联研究鉴定中国人椎间盘退行性疾病易感基因的研究

基本信息
批准号:81071513
项目类别:面上项目
资助金额:40.00
负责人:邱贵兴
学科分类:
依托单位:中国医学科学院北京协和医院
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:于斌,刘浩,李新,舒畅,周熹,冯觉非,邢泽军,陈东文
关键词:
易感基因多态性椎间盘退行性疾病全基因组相关研究
结项摘要

椎间盘退行性疾病(Degenerative Disc Disease)的发生与遗传和环境因素共作用的复杂机制有关。本研究拟采用有全基因组关联分析,进行中国人椎间盘退行性疾病易感基因的识别研究。探索中国人椎间盘退行性疾病的遗传风险因子,对揭示中国人椎间盘退行性疾病的遗传病因学有重要意义,可为进一步在椎间盘退行性疾病的分子病因学,诊断、治疗和预防上提供新的思路。本研究拟在近2-3年之内,在大样本的中国人椎间盘退行性疾病病例人群中采用先进的全基因组关联分析策略,发现和确定一定数量的中国人椎间盘退行性疾病易感基因,填补中国人的椎间盘退行性疾病易感基因空缺。将临床资料和实验室结果相结合,以研究基因-基因、基因-表型、基因-环境之间的关系。为最终获得椎间盘退行性疾病的致病基因,阐明该病的发生、发展机理奠定基础。

项目摘要

由于部分DNA样本质量达不到芯片检测的标准,导致样本数量不足,难以达到GWAS所要求的样本数目;此外,现有经费不足以支撑在大样本中进行GWAS的研究。鉴于以上条件限制,考虑到候选基因策略在疾病病因学研究中的作用,我们修改了最初的研究思路,在资金及时间均能保证的前提下,采用候选基因法对已报道的椎间盘退行性疾病的易感基因进行了有针对性地筛查,并结合影像学研究方法,取得了一系列的研究成果。1、收集到患有椎间盘退行性疾病的中国汉族人群样本1100例,并在医生指导下,如实填写有关DDD危险因素的调查问卷;收集患者血样823份,并提取基因组DNA,针对多个易感基因进行了多态性检测;收集被试影像学(包括CT及MRI)资料485份。2、发现T2及ADC值与年龄均存在显著的相关性;45岁作为一个分界点,对于T2值及ADC值的临床应用具有一定的指导意义;T2值及ADC值均可以用于探测节段相关的椎间盘改变,但ADC值可能更灵敏。3、ADAMTS-5基因的三个SNP位点—rs151058, rs229052, 和rs162502与腰椎间盘退变显著相关;在椎间盘退变患者中,rs151058与rs162502之间存在显著的相互作用;对rs162502而言, AA基因型的患者与 G+基因型患者的MD均值存在显著性的差异。截止目前已发表SCI论文2篇,分别是.(1) Comparison of Apparent Diffusion Coefficient and T2 Relaxation Time Variation Patterns in Assessment of Age and Disc Level Related Intervertebral Disc Changes”. PLOS ONE 2013 July, 8(7), e69052; .(2) The Involvement of ADAMTS-5 Genetic Polymorphisms in Predisposition and Diffusion Tensor Imaging of Lumbar Disc Degeneration”. Journal of Orthopaedics Research, 2014 Jan, DOI: 10.1002/jor.22582

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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