禾谷类作物胚乳性状多QTL定位统计方法研究

在原有工作基础上，针对三种试验设计：（1）种子单粒测定、标记基因型信息来自种子胚和性状表型值来自同一粒种子胚乳；（2）种子单粒测定、标记信息来自母体及下一代种子胚；（3）在随机交配产生后代家系基础上种子混合测定，标记信息来自已知植株（或株系）。应用极大似然估计法、Score统计量、FDR检验、贝叶斯统计分析方法、混合线性模型统计分析方法、EM算法和遗传算法等，从理论上构建一系列基于三倍体遗传模型的胚乳性状多QTL定位方法，包括基于胚乳基因上位性效应的多QTL作图统计分析方法、基于胚乳基因和母体基因上位性效应的多QTL作图统计分析方法、基于胚乳基因上位性效应和环境互作效应的多QTL作图统计分析方法。用计算机模拟实验验证所建立的胚乳性状多QTL定位方法的有效性和可行性。为实际胚乳性状QTL定位提供理论依据和手段，也为揭示胚乳性状遗传学机理提供参考，同时对谷类作物品质性状遗传改良有重要指导作用

本项目于2011年获得资助，执行时间是2012年1月至2015年12月，研究内容是基于三种试验设计：（1）种子单粒测定、标记基因型信息来自种子胚和性状表型值来自同一粒种子胚乳；（2）种子单粒测定、标记信息来自母体及下一代种子胚；（3）在随机交配产生后代家系基础上种子混合测定，标记信息来自已知植株（或株系）。应用极大似然估计法、贝叶斯等统计分析方法，从理论上构建一系列基于三倍体遗传模型的胚乳性状多QTL定位方法，用计算机模拟验证所建立的胚乳性状多QTL定位方法的有效性和可行性。在资助项目执行期间，我们开展以下方面的研究：第一，在禾谷类作物中，种子单粒测定、标记基因型信息来自种子胚和性状表型值来自同一粒种子胚乳，基于E-Bays方法的胚乳性状QTL上位性的研究，分为逆卡方先验和指数先验两种情形进行讨论；第二，在禾谷类作物中，标记基因型信息来自母体植株，胚乳性状表型值来自家系种子单粒测定，建立包含母体效应的胚乳性状QTL定位研究；第三，基于永久性F2群体的印迹QTL定位研究。用计算机模拟验证所建立的胚乳性状多QTL定位、印迹QTL定位方法的有效性和可行性。为实际胚乳性状QTL定位提供理论依据和手段，同时对谷类作物品质性状遗传改良有重要指导作用。在以上研究的同时，我们资助对H7N9禽流感病毒模型的全局动态分析等方面的研究，取得一定的成绩.资助期间共发表论文8篇，其中2篇被SCI收录。另SCI收录杂志接受一篇，另有多篇论文在撰写之中，已基本完成预期目标。