非贲门胃癌遗传易感区域致病基因和致病功能位点分析

Gastric cancer, including the cardia and non-cardia types, is the second leading cause of cancer-related deaths worldwide. Our research group has carried out a genome-wide association study (GWAS) of non-cardia gastric cancer (published in Nature Genetics), and found two new regions, 5p13.1 and 3q13.31 to be associated with non-cardia gastric cancer. Meanwhile, we also validated the association of three known regions,8q24, 1q22 and 20p13 in this study. Based on those previous findings and the technique advantages of our research group (some technology was developped by us and published in Nature Nanotechnology), we will carry out a post-GWAS research of non-cardia gastric cancer. We will try to find out the causative genes and variants of non-cardia gastric cancer in those susceptibility regions, and validate the findings by replication in large sample sets and functional experiments. Finally, our project will help us understand the etiology of non-cardia gastric cancer much better.

胃癌包括非贲门胃癌和贲门癌，其死亡率在全世界所有癌症死亡率中排名第二。项目组前期开展了非贲门胃癌的全基因组关联分析（论文发表于《Nature Genetics》杂志），发现5p13.1和3q13.31这两个区域与非贲门胃癌的遗传机制相关，但与贲门癌的发生机制没有显著相关性；同时，还成功验证了8q24、1q22和20p13这三个被报道过的与非贲门胃癌发生机制相关的区域。项目组基于此项研究成果，结合项目组已有的技术优势（部分技术为自主开发，论文发表于《Nature Nanotechnology》杂志），开展非贲门胃癌的后全基因组关联分析（post-GWAS）研究，探索全基因组关联分析发现的易感区域内的致病基因和致病功能位点，并开展大样本验证和功能验证实验，为进一步揭示非贲门胃癌的发病机制奠定基础。

胃癌包括非贲门胃癌和贲门癌，其死亡率在全世界所有癌症死亡率中排名第二。项目组前期开展了世界上首个非贲门胃癌的全基因组关联分析（论文发表于《Nature Genetics》杂志），发现 5p13.1 和 3q13.31这两个区域与非贲门胃癌的遗传机制相关，同时，还成功验证了 8q24、1q22 和 20p13 这三个被报道过的与非贲门胃癌发生机制相关的区域。在此前期基础上，本项目设计开展非贲门胃癌的后全基因组关联分析（post-GWAS）研究，深入探索全基因组关联分析发现的易感区域内的致病基因和致病功能位点，并在开展大样本验证的基础上进行功能验证实验。在项目执行期间，通过高通量测序等研究并没有发现非贲门胃癌在上述易感区域的致病功能变异位点，提示了复杂疾病功能变异的研究与分析是存在较大的难度的；而在独立的非贲门胃癌样本中对于相关性不明确的变异位点的验证实验也未能取得显著的结果。项目组依然基于本项目的支持，建立了肿瘤细胞功能实验的技术流程，并在其他肿瘤的驱动基因分析中完成了功能实验工作，也为非贲门胃癌的进一步研究奠定了基础。本项目共计发表34篇SCI论文，相关研究内容申请了7项PCT专利。