中国人2型糖尿病易感位点7q32中致病位点的定位及其机制研究

基本信息
批准号:81570713
项目类别:面上项目
资助金额:58.00
负责人:胡承
学科分类:
依托单位:上海交通大学
批准年份:2015
结题年份:2019
起止时间:2016-01-01 - 2019-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王婕,沈云岳,江枫,周舟,彭丹凤,陈淼,严婧,梁雷
关键词:
深度测序精细定位致病变异
结项摘要

Type 2 diabetes mellitus (T2D) is a complex disease caused by both genetic and environmental factors. Though over 90 T2D susceptible loci have been identified, most of them were genetic markers and could only explain ~15% genetic susceptibility of T2D. Therefore it is imperative to detect potential causal variants for T2D. Previously, we identified 9 novel T2D susceptible loci in East Asians. Among them, 2 (rs10229583 and rs6467136) located in 7q32 region, indicating some casual variants might be existed in this region. Based on this, we plan to perform fine mapping in 7q32 region to detect potential casual variants through deep sequencing, large-size sample validation and bioinformatics analysis. Moreover, we will elucidate the mechanism and investigate the predicting effects of the casual variants. Our research is of importance to know the genetic mechanism, and will promote the prediction and personalized therapy of type 2 diabetes as well.

2型糖尿病是遗传和环境因素共同作用的复杂疾病,尽管已发现90余个2型糖尿病易感位点,但多为遗传标记,缺乏功能解析,且仅能解释~15%的遗传易感性,故遗传机制研究亟需从发现2型糖尿病的易感位点向定位功能性致病位点发展。课题组前期通过全基因组关联研究定位了9个东亚人群2型糖尿病新易感位点,其中rs10229583和rs6467136两个独立位点均位于7q32区域,提示该区域可能存在多个疾病的致病位点。本课题在此基础上,通过对7q32区域的目标区域捕获测序,并结合大样本病例-对照人群验证、生物信息学分析和分子细胞生物学实验,明确该区域疾病的致病位点,阐明致病位点参与2型糖尿病发生的分子机制,并通过前瞻及药物基因组学研究队列,明确这些致病位点在2型糖尿病预警和个体化干预中的作用。本研究对认识中国人2型糖尿病遗传特点及病理生理机制有重要意义,并将推动遗传因素对疾病的早期预测及个体化诊疗进程。

项目摘要

本项目旨在通过对7q32区域开展深度测序,发现直接影响2型糖尿病(T2D)发病的致病位点并深入解析其致病机制,评价其在指导疾病预警及个体化诊疗中的价值,为阐明疾病的发病机制提供重要新思路,亦为促进2型糖尿病的分型、帮助风险人群早期预警并指导临床个体化诊疗提供重要的理论依据。项目按计划进展顺利。通过目标区域捕获测序发现PAX4基因外显子区域变异R192H,并开展功能研究。构建PAX4敲除的Mel1多能干细胞,发现PAX4-/-细胞可影响胰岛内分泌前体细胞向胰岛β细胞的定向分化,使得定向分化的β细胞数量显著减少,产生胰岛素能力减弱。此外,还通过群体遗传学研究,构建“中国人2型糖尿病遗传风险评估模型”可用于筛选糖尿病高危人群,构建“药物疗效遗传评估模型”,用于指导个体化用药,并通过孟德尔随机化分析解析了不同因素致T2D及大血管病变的因果关联。研究成果获得授权发明专利1项,并转化形成商品化芯片,在全国300余家医疗机构推广应用。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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