利用全外显子捕获测序技术寻找中国人2型糖尿病的易感基因

基本信息
批准号:81170735
项目类别:面上项目
资助金额:58.00
负责人:胡承
学科分类:
依托单位:上海交通大学
批准年份:2011
结题年份:2015
起止时间:2012-01-01 - 2015-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:沈丽,王婕,魏伟,华飞,沈云岳,虞伟慧,秦雯,王申奇
关键词:
深度测序外显子组2型糖尿病遗传
结项摘要

2型糖尿病是一个由遗传和环境因素共同参与的复杂疾病。尽管全基因组关联研究已发现43个2型糖尿病易感基因,它们也仅仅能解释不到10%的疾病遗传易感性。因此,使用新的研究方法,系统的寻找2型糖尿病易感位点是亟需解决的科学难题。课题组自2010年开始探索性的开展了中国人2型糖尿病全外显子捕获测序实验。初步结果显示,部分可导致氨基酸改变的新变异可能是潜在的2型糖尿病易感位点。本课题拟以此重要发现为基础,首先在6774例病例-对照样本中对这些候选易感位点进行检测和遗传关联分析,发现疾病易感位点。同时,再入选235个2型糖尿病家系进行家系关联研究进一步验证,经确定的易感位点,将开展初步的功能实验,为阐明其参与疾病发生的分子机制奠定基础。本研究对认识中国人2型糖尿病遗传机制具有重要理论意义,并将推动2 型糖尿病病因学研究及中国人2型糖尿病遗传流行病学研究的进程。

项目摘要

本项目主要聚焦于通过全外显子组测序寻找中国人2型糖尿病的“致病”位点。我们对31个具备特殊糖尿病表型、携带2型糖尿病已知易感位点少的患者,进行了全外显子组测序,发现一个具有严重糖尿病临床特征的患者携带INS基因信号肽上的一个错义突变p.Ala2Thr (A2T)。随后,在大样本病例-对照人群(6523个病例和4635个对照)中进行验证,发现该变异占病例人群的0.06%,而在对照组中未发现该突变。对A2T突变的功能学研究发现A2T突变胰岛素较野生型胰岛素相比,大量蓄积于内质网中,引起内质网分子伴侣(CRT、Calreticulum、BIP)以及内质网应激通路的激活 (PERK-p-eIF2α-ATF4,p-IRE1α-sXBP1)。因此,我们推测INS基因的A2T突变通过引起内质网应激导致2型糖尿病的发生,是中国人2型糖尿病的“致病”突变。此外,我们还进行了中国人2型糖尿病及其并发症的遗传学研究。通过全基因组关联研究发现了中国人2型糖尿病新易感基因PAX4,其rs10229583位点与2型糖尿病密切相关(P = 2.6×10-8);验证发现ZNRF1,COLEC12, SCYL1BP1及API5与中国人糖尿病视网膜病变及病变程度相关。药物基因组学方面,发现PAX4、KCNQ1、PSMD6基因影响罗格列酮或者瑞格列奈的药物降糖疗效。以上原创性研究成果进一步了解析中国人2型糖尿病遗传特点,并为深入揭示其遗传机制奠定了基础,亦为转化应用于指导临床个体化治疗提供了理论指导。本项目累计发表SCI论文17篇,其中IF>5分为6篇,培养硕博士研究生共7名。获省部级科技进步一等奖两项。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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